More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0155 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  99.59 
 
 		 243 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  99.59 
 
 		 243 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  93.59 
 
 		 248 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  93.16 
 
 		 244 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  66.04 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  66.04 
 
 		 231 aa  268  8e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  65.09 
 
 		 233 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  65.71 
 
 		 236 aa  263  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  65.09 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  65.09 
 
 		 233 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  51.77 
 
 		 231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  52.44 
 
 		 230 aa  218  7e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 230 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  48.47 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.72 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 224 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  47.39 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.17 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  41.77 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  50.88 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 406 aa  188  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  51.75 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  42.34 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  43.59 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  45.74 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  45.37 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  40.27 
 
 		 227 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  43.91 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 226 aa  182  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  42.08 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.05 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  45.95 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  45.64 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.73 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  46.67 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.05 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  40.61 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>