More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0105 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  75.34 
 
 
554 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  59.52 
 
 
534 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
556 aa  1122    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.82 
 
 
556 aa  1120    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  79.26 
 
 
579 aa  890    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.82 
 
 
556 aa  1120    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  82.44 
 
 
570 aa  903    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  59.65 
 
 
525 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  57.56 
 
 
534 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  55.99 
 
 
527 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  53.58 
 
 
526 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  52.01 
 
 
1043 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  47.36 
 
 
520 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 
516 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  42.52 
 
 
518 aa  346  6e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  41.77 
 
 
532 aa  345  8.999999999999999e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 
514 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.52 
 
 
517 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.52 
 
 
517 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  42.52 
 
 
517 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  40.61 
 
 
534 aa  326  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.9 
 
 
503 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 
499 aa  325  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 
509 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 
530 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  38.48 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 
540 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 
514 aa  306  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 
520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 
509 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
520 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  39.23 
 
 
508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 
541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 
524 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
520 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 
511 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
518 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
515 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
515 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 
522 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 
511 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 
519 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 
520 aa  297  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  37.91 
 
 
513 aa  296  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 
508 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  35.7 
 
 
520 aa  295  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
518 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 
518 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  35.64 
 
 
496 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.86 
 
 
525 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  35.32 
 
 
496 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  35.64 
 
 
496 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
518 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 
515 aa  294  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.69 
 
 
526 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 
508 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 
525 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 
501 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
518 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.62 
 
 
525 aa  289  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.59 
 
 
525 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  34.52 
 
 
496 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.5 
 
 
516 aa  289  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 
522 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 
522 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.09 
 
 
526 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.77 
 
 
526 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 
525 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  38.69 
 
 
516 aa  287  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 
662 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.76 
 
 
530 aa  286  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 
509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 
523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
512 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  35.88 
 
 
531 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
553 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  35.51 
 
 
529 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 
551 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3198  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
525 aa  280  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  35.09 
 
 
522 aa  280  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 
519 aa  279  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.68 
 
 
518 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 
524 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
518 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  36.47 
 
 
503 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
530 aa  277  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 
505 aa  277  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.49 
 
 
518 aa  277  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
520 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 
502 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
551 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  32.68 
 
 
520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.68 
 
 
518 aa  274  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
500 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  37.12 
 
 
529 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.07 
 
 
518 aa  273  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>