279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0024 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  405  1e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  405  1e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  405  1e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
215 aa  171  7e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
184 aa  163  2e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 
207 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
202 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 
192 aa  131  8e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 
193 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  40 
 
 
195 aa  120  1e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
193 aa  119  2e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
195 aa  114  1e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
196 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  43.17 
 
 
190 aa  101  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
196 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  44.04 
 
 
194 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
209 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  41.38 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
194 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
189 aa  84.3  1e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 
195 aa  84  2e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
176 aa  82.8  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.47 
 
 
190 aa  82.4  4e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 
188 aa  82.4  5e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
192 aa  81.6  7e-15  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 
204 aa  81.6  8e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
178 aa  80.5  1e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
178 aa  80.5  1e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
195 aa  79  4e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 
214 aa  79.3  4e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
202 aa  78.6  6e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 
186 aa  78.2  9e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 
181 aa  77  2e-13  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  33.97 
 
 
197 aa  75.9  3e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 
198 aa  75.5  4e-13  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  39.25 
 
 
174 aa  74.7  9e-13  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
174 aa  73.9  1e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 
208 aa  73.9  1e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
211 aa  74.3  1e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
193 aa  73.6  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
207 aa  72.8  4e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
196 aa  72.4  4e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
184 aa  72  6e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
250 aa  71.6  7e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
198 aa  71.2  1e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 
199 aa  70.9  1e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
185 aa  70.9  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  39.45 
 
 
182 aa  70.9  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 
197 aa  70.1  2e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.6 
 
 
188 aa  69.7  3e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.39 
 
 
190 aa  69.3  3e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 
207 aa  69.3  4e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
193 aa  68.9  5e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
217 aa  68.2  7e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 
192 aa  67.8  1e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
199 aa  67.4  1e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
201 aa  67.4  2e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
194 aa  66.6  2e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 
186 aa  67  2e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  28.76 
 
 
218 aa  66.6  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 
188 aa  66.2  3e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
194 aa  66.2  3e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
194 aa  66.2  3e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 
228 aa  66.6  3e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
219 aa  65.9  4e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 
199 aa  65.9  4e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 
203 aa  65.5  6e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
196 aa  64.7  8e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
189 aa  64.7  8e-10  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
184 aa  64.7  9e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
227 aa  64.7  9e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
259 aa  64.7  1e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 
229 aa  64.3  1e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
193 aa  64.3  1e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
188 aa  63.9  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  39.5 
 
 
209 aa  63.9  2e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 
188 aa  63.5  2e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 
199 aa  63.9  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
206 aa  62.8  3e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
223 aa  62.4  4e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
184 aa  62.8  4e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 
217 aa  62.4  4e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
186 aa  62  6e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
184 aa  62  6e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
229 aa  61.6  7e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
223 aa  61.6  8e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  3.24052e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
184 aa  60.5  1e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  36.27 
 
 
202 aa  61.2  1e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
236 aa  60.8  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
266 aa  60.1  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 
192 aa  60.5  2e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  35.56 
 
 
237 aa  59.3  4e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
213 aa  59.3  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 
299 aa  58.9  5e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 
222 aa  58.9  5e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>