86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3235 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3235  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  100 
 
 		 437 aa  899    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1161  anti-sigma-factor antagonist  30.38 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.871215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 111 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 110 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1506  anti-sigma-factor antagonist  26.05 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  36.89 
 
 		 108 aa  73.6  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  32.74 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  34.04 
 
 		 116 aa  69.7  0.0000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.96 
 
 		 110 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  29.31 
 
 		 123 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1796  hypothetical protein  23.83 
 
 		 782 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.97 
 
 		 112 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.97 
 
 		 112 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2860  anti-anti-sigma factor  24.88 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 110 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  32.61 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 116 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.04 
 
 		 110 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 111 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  30.93 
 
 		 111 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  30.93 
 
 		 111 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 142 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  28.3 
 
 		 111 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 116 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.73 
 
 		 116 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  28.42 
 
 		 249 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 110 aa  53.5  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  32.65 
 
 		 123 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 116 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  26.79 
 
 		 111 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  28.28 
 
 		 111 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1146  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.7 
 
 		 134 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0512464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4443  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 114 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 111 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  27.17 
 
 		 269 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 122 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 117 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 114 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  27.97 
 
 		 124 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 116 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0998  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 123 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5403  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 118 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  33.96 
 
 		 110 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  21.3 
 
 		 111 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  25.24 
 
 		 120 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  26.61 
 
 		 111 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0007  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 101 aa  48.9  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000178812  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13718  anti-anti-sigma factor rsfB  26.13 
 
 		 122 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.237109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.12 
 
 		 115 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2303  anti-sigma-factor antagonist  28.07 
 
 		 114 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.923761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 116 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5017  anti-sigma-factor antagonist  27.73 
 
 		 119 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  28.87 
 
 		 112 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2062  anti-sigma F factor antagonist (stage II sporulation protein AA)  26.26 
 
 		 99 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.360402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  25.49 
 
 		 116 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  23.36 
 
 		 120 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0046  anti-sigma-factor antagonist  28.04 
 
 		 117 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  24.35 
 
 		 123 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  26.09 
 
 		 123 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  25.25 
 
 		 111 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  22.02 
 
 		 113 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2253  anti-sigma-factor antagonist  30.59 
 
 		 136 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326742  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  25.45 
 
 		 117 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 118 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  23.48 
 
 		 183 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  24.3 
 
 		 120 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3003  anti-sigma-factor antagonist  28 
 
 		 130 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2409  anti-sigma-factor antagonist  27.62 
 
 		 112 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  23.58 
 
 		 111 aa  44.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  25.66 
 
 		 142 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 		 106 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 134 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  27.38 
 
 		 151 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4272  anti sigma b factor antagonist RsbV  21.78 
 
 		 112 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0129629  hitchhiker  0.00320948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 122 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2671  anti-sigma-factor antagonist  27.4 
 
 		 119 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2714  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 99 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0990  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.77 
 
 		 111 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0926  anti sigma b factor antagonist RsbV  22.77 
 
 		 111 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  24.1 
 
 		 110 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2937  anti-sigma-factor antagonist  22.77 
 
 		 101 aa  43.5  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  25.71 
 
 		 113 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0894  anti-sigma B factor antagonist  22.77 
 
 		 111 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>