23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3138 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3138  hypothetical protein  100 
 
 
768 aa  1546    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000469073  hitchhiker  0.00590217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3066  hypothetical protein  23.9 
 
 
815 aa  150  8e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.690569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0175  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  22.18 
 
 
812 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0785  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.09 
 
 
884 aa  140  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.826413  normal  0.126691 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2859  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  22.73 
 
 
854 aa  137  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000287651  normal  0.328764 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2270  hypothetical protein  24.9 
 
 
840 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807987  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1209  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.11 
 
 
872 aa  129  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00285294 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0249  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  21.14 
 
 
863 aa  121  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0662  hypothetical protein  24.27 
 
 
868 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1579  transmembrane oligosaccharyl transferase  23.38 
 
 
824 aa  104  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00308238  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3149  hypothetical protein  31.17 
 
 
808 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.322699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1498  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  21.74 
 
 
891 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2235  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  27.35 
 
 
881 aa  82  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0242  transmembrane oligosaccharyl transferase  23.58 
 
 
837 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0243  transmembrane oligosaccharyl transferase  23.27 
 
 
840 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0927  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  31.01 
 
 
961 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2808  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  22.95 
 
 
1045 aa  65.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1164  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  24.02 
 
 
736 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297002  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0310  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.58 
 
 
2073 aa  52  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2752  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  23.39 
 
 
1030 aa  51.2  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.779592 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2957  Oligosaccharyl transferase STT3 subunit  28.37 
 
 
998 aa  50.8  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1548  oligosaccharyl transferase, STT3 subunit  23.97 
 
 
704 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0368  oligosaccharyl transferase  20.11 
 
 
836 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>