More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3038 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
878 aa  1798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
681 aa  239  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
839 aa  197  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
1426 aa  194  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  25.23 
 
 
1113 aa  193  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
815 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
1253 aa  185  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 
1390 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
488 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
3706 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  41.05 
 
 
783 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
613 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
1246 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
524 aa  171  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
788 aa  169  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
382 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
657 aa  165  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.98 
 
 
1668 aa  165  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
771 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
1093 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
439 aa  164  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
1093 aa  164  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
1654 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  37.23 
 
 
744 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
913 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
945 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
980 aa  160  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  38.26 
 
 
1663 aa  160  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.28 
 
 
1239 aa  159  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
1051 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
572 aa  156  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
551 aa  156  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  35.47 
 
 
754 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
909 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
347 aa  154  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
2693 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
991 aa  153  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
964 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
1560 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  27.48 
 
 
945 aa  152  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
1714 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
732 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
834 aa  151  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
872 aa  150  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
1676 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  37.39 
 
 
918 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
1227 aa  149  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
472 aa  148  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  32.77 
 
 
1210 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
749 aa  147  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.57 
 
 
886 aa  147  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
746 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  37.45 
 
 
676 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
547 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
764 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
747 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
752 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
813 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
789 aa  144  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
1039 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
1051 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
215 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 
474 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
932 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5461  signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
732 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
1177 aa  142  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
912 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 
400 aa  142  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  29.46 
 
 
746 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
472 aa  141  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  33.6 
 
 
1182 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
766 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  41.36 
 
 
1265 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  34.69 
 
 
704 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
782 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  29.17 
 
 
1047 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
1093 aa  140  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
462 aa  139  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
674 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
757 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
767 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
631 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
856 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.89 
 
 
892 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
603 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  37.85 
 
 
1289 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  34.24 
 
 
483 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
774 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  30.68 
 
 
1248 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  33.84 
 
 
657 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
358 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  41.52 
 
 
511 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
790 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
941 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
1121 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
358 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
381 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  35.81 
 
 
637 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 
771 aa  135  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>