More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3023 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  69.55 
 
 		 441 aa  634    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  100 
 
 		 437 aa  887    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  72.48 
 
 		 440 aa  658    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  72.67 
 
 		 443 aa  656    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  68.65 
 
 		 446 aa  624  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  59.5 
 
 		 439 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  56.85 
 
 		 443 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  56.36 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.28 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  54.06 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.53 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  48.76 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  47.64 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  47.64 
 
 		 450 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  53.6 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  51.48 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  49.32 
 
 		 449 aa  425  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  46.74 
 
 		 450 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  47.19 
 
 		 450 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  44.03 
 
 		 446 aa  372  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  43.82 
 
 		 442 aa  330  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  41.41 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  39.46 
 
 		 449 aa  329  6e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  40.52 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  42.56 
 
 		 447 aa  320  3e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.37 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  41.89 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  40.38 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  40.32 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  36.63 
 
 		 513 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  40.22 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  38.88 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  37.3 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0128602 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  38.22 
 
 		 542 aa  280  3e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  37.89 
 
 		 479 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  38.12 
 
 		 591 aa  276  6e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  37.86 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  35.65 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.25 
 
 		 481 aa  271  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  36.32 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1773  hypothetical protein  36.2 
 
 		 442 aa  270  4e-71  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.128152 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  33.86 
 
 		 439 aa  270  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  36.06 
 
 		 435 aa  269  7e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  35.43 
 
 		 444 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2836  signal recognition particle protein  37.5 
 
 		 447 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.533211  decreased coverage  0.000777787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  36.43 
 
 		 450 aa  265  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  34.81 
 
 		 476 aa  264  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  34.6 
 
 		 448 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  35.36 
 
 		 446 aa  264  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.18 
 
 		 446 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  36.07 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0457  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.24 
 
 		 507 aa  263  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.135401  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  36.07 
 
 		 447 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.2 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3035  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.99 
 
 		 454 aa  263  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  35.01 
 
 		 518 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2279  signal recognition particle protein  38.01 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000146943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1399  signal recognition particle protein  35.2 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000293601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  34.83 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  34.65 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  34.65 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  34.65 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  34.65 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  34.65 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.24 
 
 		 447 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  35.56 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  34.65 
 
 		 449 aa  259  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 449 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 449 aa  259  9e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 449 aa  259  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  35.07 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  35.44 
 
 		 508 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  35.65 
 
 		 469 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0965  Signal recognition particle protein  35.43 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000805339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3304  signal recognition particle protein  34.18 
 
 		 492 aa  257  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.58 
 
 		 447 aa  257  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  34.76 
 
 		 521 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  34.11 
 
 		 455 aa  256  8e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  37.97 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  34.19 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1014  signal recognition particle protein  34.32 
 
 		 449 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  34.11 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  35.57 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1291  signal recognition particle protein  34.91 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0012852  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  36.34 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  33.33 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  35.62 
 
 		 451 aa  253  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0645  signal recognition particle protein  34.21 
 
 		 434 aa  254  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.196271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1493  signal recognition particle protein  34.73 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000265163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1115  signal recognition particle protein  35.32 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  34.42 
 
 		 445 aa  253  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.6 
 
 		 443 aa  253  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.35 
 
 		 452 aa  252  7e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0589  signal recognition particle protein  34.91 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  35.03 
 
 		 458 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0572  signal recognition particle protein  34.91 
 
 		 492 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3368  signal recognition particle protein  36.01 
 
 		 550 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>