More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2922 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1405  ATPase  52.62 
 
 		 671 aa  683    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  100 
 
 		 655 aa  1323    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2007  ATPase  61.83 
 
 		 631 aa  808    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00148189  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  61.86 
 
 		 642 aa  811    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  63.25 
 
 		 658 aa  849    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  42.57 
 
 		 602 aa  528  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3490  ATPase  40.92 
 
 		 640 aa  499  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.622466  normal  0.276666 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1791  ATPase  40.85 
 
 		 618 aa  499  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00115762  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  40.46 
 
 		 625 aa  493  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  40.71 
 
 		 633 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  41.6 
 
 		 629 aa  482  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1543  PilT protein domain protein  39.79 
 
 		 631 aa  476  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0722  ATPase  38.19 
 
 		 633 aa  458  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0212836  normal  0.622935 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1284  ATPase  36.77 
 
 		 630 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1392  ATPase  36.15 
 
 		 630 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0672  ATPase  36.46 
 
 		 630 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.215241  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1292  ATPase  37.06 
 
 		 634 aa  415  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1247  ATPase  36.16 
 
 		 651 aa  409  1e-113  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0622  PilT protein domain protein  35.47 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1054  ATPase  33.94 
 
 		 605 aa  374  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0536  ATPase  38.72 
 
 		 530 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1925  ATPase  36.88 
 
 		 506 aa  301  3e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1639  Nucleotide binding protein PINc  33.85 
 
 		 510 aa  290  6e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.917649  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1101  ATPase  34.72 
 
 		 517 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1721  ATPase  34.79 
 
 		 518 aa  275  3e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0370491  decreased coverage  0.0000123614 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1385  ATPase  32.91 
 
 		 519 aa  270  7e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0298  ATPase  33.13 
 
 		 521 aa  270  8e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.350662  normal  0.0582555 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0407  ATPase  33.75 
 
 		 520 aa  263  8e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  26.88 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  29.57 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  29.57 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  27.08 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  25.39 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.97 
 
 		 489 aa  55.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  32.5 
 
 		 423 aa  55.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  25.81 
 
 		 462 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  33.33 
 
 		 428 aa  54.7  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 428 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  26.96 
 
 		 521 aa  54.7  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  27.86 
 
 		 462 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  33.33 
 
 		 428 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0628  type II secretion system protein E  29.05 
 
 		 521 aa  55.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  32.58 
 
 		 476 aa  54.7  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  30.99 
 
 		 384 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  32.28 
 
 		 361 aa  53.5  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 596 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  30.83 
 
 		 428 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  27.75 
 
 		 597 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 566 aa  53.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 567 aa  53.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 358 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 357 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  24.66 
 
 		 677 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  24.66 
 
 		 684 aa  52  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 357 aa  52  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  27.88 
 
 		 613 aa  51.2  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 484 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 467 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 490 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  24.78 
 
 		 440 aa  51.6  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 522 aa  51.6  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 557 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  24.72 
 
 		 463 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  28.96 
 
 		 501 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  28.15 
 
 		 488 aa  50.8  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 449 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 557 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  26.7 
 
 		 560 aa  50.8  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  30.66 
 
 		 369 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1643  twitching motility protein PilT  29.45 
 
 		 361 aa  50.8  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 408 aa  50.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  25.25 
 
 		 601 aa  50.8  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 806 aa  50.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  29.57 
 
 		 613 aa  50.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  29.1 
 
 		 482 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 538 aa  50.4  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 492 aa  50.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  29.37 
 
 		 346 aa  50.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  29.17 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  28.3 
 
 		 568 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  32.79 
 
 		 482 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  34.31 
 
 		 371 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  27.82 
 
 		 455 aa  50.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 477 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  27.16 
 
 		 603 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  28.15 
 
 		 489 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  29.91 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.15 
 
 		 482 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  29.93 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  29.93 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  26.99 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  31.69 
 
 		 269 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  27.94 
 
 		 485 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 488 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 503 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 343 aa  49.7  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  30.07 
 
 		 333 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6217  type II secretion system protein E  31.3 
 
 		 500 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>