More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2918 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
408 aa  826    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
409 aa  501  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 
410 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
410 aa  472  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1585  histidyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
409 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
377 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
418 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
418 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
418 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
418 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
414 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
424 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
420 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
423 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
423 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
423 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
434 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
423 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
436 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
434 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
400 aa  222  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
424 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
423 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
421 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
424 aa  219  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
419 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
418 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
419 aa  219  7e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
429 aa  216  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
415 aa  215  9e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
430 aa  213  7e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
421 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
414 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2219  histidyl-tRNA synthetase  35.06 
 
 
442 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.911192  normal  0.722289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  32.95 
 
 
421 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
415 aa  209  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 
418 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
414 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
433 aa  209  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  33.74 
 
 
415 aa  208  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
414 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  35.93 
 
 
422 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  34.59 
 
 
423 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
436 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
430 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  34.86 
 
 
421 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  34.83 
 
 
423 aa  206  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
423 aa  206  8e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
432 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 
424 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
429 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
422 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
415 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
431 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
426 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  35.75 
 
 
421 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
429 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
425 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
420 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
420 aa  203  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 
420 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
424 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
421 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 
421 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
445 aa  202  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
418 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  33.88 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
420 aa  200  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
417 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
426 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
422 aa  199  7e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0385  histidyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
410 aa  199  9e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000994086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 
425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>