More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2832 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  100 
 
 
234 aa  481  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  52.74 
 
 
202 aa  221  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  52.24 
 
 
202 aa  221  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  49.75 
 
 
202 aa  209  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  51.98 
 
 
202 aa  199  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  40.29 
 
 
210 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 
210 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 
210 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  45.07 
 
 
210 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  42.65 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  39.81 
 
 
210 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  40.2 
 
 
212 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 
233 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 
209 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  40.28 
 
 
227 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  39.42 
 
 
215 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  40.67 
 
 
225 aa  148  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  39.9 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 
226 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 
245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  36.04 
 
 
244 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  35.59 
 
 
244 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 
227 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  37.33 
 
 
234 aa  143  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  37.1 
 
 
226 aa  142  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  36.23 
 
 
213 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  40.2 
 
 
216 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  36.54 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  36.97 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 
212 aa  138  7e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 
223 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  38.28 
 
 
217 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  37.02 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  37.14 
 
 
215 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  37.02 
 
 
215 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 
215 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  37.86 
 
 
215 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  37.02 
 
 
215 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  39.9 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  37.68 
 
 
214 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 
214 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  40.49 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  37.67 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  37.56 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  37.56 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  37.32 
 
 
217 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  38.46 
 
 
216 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  39.81 
 
 
212 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  33.8 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  37.04 
 
 
193 aa  125  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 
223 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  35.05 
 
 
223 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  32.23 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  34.26 
 
 
220 aa  111  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 
208 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 
222 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 
210 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  32.73 
 
 
211 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  31.1 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.35 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 
195 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  32.35 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1846  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260546  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  32.39 
 
 
197 aa  92.4  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  33.33 
 
 
235 aa  91.7  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  35.77 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 
231 aa  89  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 
230 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0593  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  28.64 
 
 
205 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  30.88 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1757  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 
247 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0318  queuosine biosynthesis protein QueE  29.34 
 
 
233 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  29.74 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1785  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  27.75 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  34.53 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  30.23 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 
246 aa  82  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  29.27 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1221  hypothetical protein  32.14 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.688566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1382  hypothetical protein  32.14 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.980113  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>