217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2809 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  47.46 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  44.13 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  42.13 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  40.11 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  38.5 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  39.43 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  39.89 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  33.88 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  35.16 
 
 		 181 aa  101  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  35.29 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.53 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.61 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  34.22 
 
 		 194 aa  95.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  35.33 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  33.69 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  34.78 
 
 		 184 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 201 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  30.29 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  31.38 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  32.79 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.38 
 
 		 193 aa  90.9  9e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  34.68 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 173 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  34.68 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 195 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  37.02 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  32.56 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  32.81 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 188 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  29.63 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.69 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  29.19 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.03 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  30.91 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  32.82 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  31.65 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  29.84 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  26.59 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  32.39 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  31.11 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  32.06 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  30.17 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  30.6 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.11 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  29.73 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  32.06 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.89 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  32.76 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  32.33 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  28.02 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  28.81 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  30.9 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  28.09 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  31.18 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  32.62 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  27.91 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.04 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  30.32 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  31.18 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  30.83 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.96 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.07 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  30.53 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  31.78 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  31.78 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  30.6 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  31.78 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>