More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2749 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2749  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 436 aa  900    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.5 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 440 aa  311  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2712  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 1049 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.09 
 
 		 980 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 576 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 		 566 aa  156  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0987  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  36.46 
 
 		 306 aa  136  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.03 
 
 		 869 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.96 
 
 		 869 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0355  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.61 
 
 		 464 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2357  putative PAS/PAC sensor protein  34.08 
 
 		 381 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 239 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 768 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 236 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  40.98 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  40.98 
 
 		 457 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 236 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 374 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.29 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  40.98 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 		 226 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  40.98 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.38 
 
 		 231 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 234 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 407 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 230 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 223 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 121 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 236 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 236 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 225 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  30.46 
 
 		 229 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 		 619 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 231 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  100  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 225 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  37.93 
 
 		 121 aa  99.8  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  37.04 
 
 		 236 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  40.98 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.5 
 
 		 1418 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  38.52 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 236 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.16 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.81 
 
 		 233 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 225 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  37.68 
 
 		 226 aa  98.6  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 1002 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  29.82 
 
 		 232 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.09 
 
 		 225 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 231 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26.07 
 
 		 1340 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 236 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  37.01 
 
 		 231 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.08 
 
 		 234 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.16 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.51 
 
 		 243 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 226 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1118  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000972917  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  36.57 
 
 		 237 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.57 
 
 		 237 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  36.57 
 
 		 237 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3089  winged helix family two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 224 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  32.21 
 
 		 231 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  97.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  36.57 
 
 		 237 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  38.52 
 
 		 457 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  33.1 
 
 		 229 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  37.88 
 
 		 229 aa  97.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 236 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 1322 aa  97.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1096 aa  97.1  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  38.33 
 
 		 382 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 235 aa  96.7  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1720  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 301 aa  96.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.17 
 
 		 222 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 243 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 369 aa  96.7  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8520  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 224 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  38.98 
 
 		 234 aa  96.7  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  30.29 
 
 		 227 aa  96.3  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.66 
 
 		 905 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.25 
 
 		 226 aa  96.3  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  35.82 
 
 		 237 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1651 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.88 
 
 		 216 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  35.82 
 
 		 237 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  35.82 
 
 		 237 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3242  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  35.82 
 
 		 237 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>