198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2740 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  100 
 
 
173 aa  356  9e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  59.28 
 
 
167 aa  201  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  56.97 
 
 
166 aa  197  4e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  56.36 
 
 
166 aa  186  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  55.69 
 
 
168 aa  185  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  54.22 
 
 
166 aa  184  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  54.22 
 
 
166 aa  182  2e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  53.94 
 
 
166 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  53.94 
 
 
165 aa  175  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  52.73 
 
 
165 aa  173  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  52.47 
 
 
166 aa  171  3e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  51.85 
 
 
166 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  52.47 
 
 
166 aa  170  7e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  50 
 
 
166 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  50.91 
 
 
166 aa  166  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  51.53 
 
 
165 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  51.53 
 
 
165 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  50.3 
 
 
165 aa  164  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  50 
 
 
166 aa  162  2e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  49.7 
 
 
168 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  50.32 
 
 
158 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  50.31 
 
 
166 aa  156  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  47.24 
 
 
166 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  46.01 
 
 
166 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  50 
 
 
168 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  50.62 
 
 
164 aa  151  3e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  46.01 
 
 
166 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  47.24 
 
 
166 aa  150  6e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  44.38 
 
 
167 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  48.78 
 
 
166 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  49.38 
 
 
168 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  46.63 
 
 
165 aa  145  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  48.12 
 
 
164 aa  145  4e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  37.91 
 
 
184 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  46.01 
 
 
168 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  39.89 
 
 
185 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  48.19 
 
 
172 aa  142  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  49.7 
 
 
163 aa  142  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  50.61 
 
 
165 aa  141  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  46.63 
 
 
165 aa  141  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  43.56 
 
 
163 aa  141  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  36.93 
 
 
184 aa  140  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  45.4 
 
 
166 aa  139  1e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  44.79 
 
 
166 aa  139  2e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  48.15 
 
 
164 aa  139  2e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  36.93 
 
 
184 aa  138  4e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  46.63 
 
 
164 aa  137  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  46.63 
 
 
164 aa  135  3e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  40.49 
 
 
169 aa  135  3e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  40.96 
 
 
170 aa  134  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  40.96 
 
 
170 aa  134  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  42.59 
 
 
169 aa  134  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  48.7 
 
 
167 aa  134  7e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  41.81 
 
 
185 aa  133  1e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  37.35 
 
 
170 aa  128  4e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  38.51 
 
 
182 aa  128  4e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  39.33 
 
 
182 aa  128  4e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  40.12 
 
 
167 aa  127  8e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  41.77 
 
 
168 aa  126  1e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  34.86 
 
 
182 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  45.28 
 
 
169 aa  118  4e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  37.29 
 
 
228 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  38.86 
 
 
177 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  36.14 
 
 
178 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  40.36 
 
 
167 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  39.18 
 
 
216 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.15937e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  34.81 
 
 
184 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  38.82 
 
 
183 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  38.82 
 
 
183 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  37.36 
 
 
215 aa  101  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  38.82 
 
 
183 aa  101  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  40.68 
 
 
182 aa  100  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  37.06 
 
 
178 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  37.36 
 
 
263 aa  98.2  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  34.64 
 
 
181 aa  97.8  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.48271e-09  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  41.01 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  32.37 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  36 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  36.47 
 
 
392 aa  95.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  43.65 
 
 
140 aa  94.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.07 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  43.51 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  42.34 
 
 
146 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  35.63 
 
 
215 aa  92.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  34.55 
 
 
179 aa  92  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  36.2 
 
 
233 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  34.46 
 
 
191 aa  92  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.77128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  33.68 
 
 
197 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  37.65 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  34.83 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  34.09 
 
 
179 aa  90.9  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  42.4 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.19 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  35.84 
 
 
179 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  36.75 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  2.89321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  33.53 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  32.42 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  36.31 
 
 
696 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  41.35 
 
 
139 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  3.45358e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  33.9 
 
 
179 aa  89  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>