More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2626 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
858 aa  644    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  68.38 
 
 
863 aa  1264    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  55.34 
 
 
869 aa  1008    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
906 aa  813    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
865 aa  1807    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
886 aa  806    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
865 aa  1010    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  67.68 
 
 
864 aa  1273    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
886 aa  793    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  68.68 
 
 
863 aa  1256    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
855 aa  967    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
886 aa  798    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  62.53 
 
 
865 aa  1168    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
886 aa  802    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
809 aa  736    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
905 aa  611  1e-173  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
896 aa  601  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
908 aa  590  1e-167  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
928 aa  586  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
892 aa  559  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
802 aa  521  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
816 aa  511  1e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
808 aa  504  1e-141  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
808 aa  495  9.999999999999999e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
864 aa  484  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
771 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 
882 aa  472  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
881 aa  465  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
799 aa  463  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
881 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 
881 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
799 aa  458  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
806 aa  457  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.99 
 
 
886 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.66 
 
 
858 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
880 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 
880 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
885 aa  452  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
845 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
799 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 
865 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.37 
 
 
836 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.38 
 
 
846 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
880 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 
885 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
865 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
877 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
879 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  33.09 
 
 
861 aa  442  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
879 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
876 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
882 aa  442  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
902 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  33.38 
 
 
884 aa  437  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
911 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 
903 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
874 aa  434  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 
883 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
894 aa  436  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  31.73 
 
 
901 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 
855 aa  430  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  32.13 
 
 
916 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  31.87 
 
 
906 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 
881 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
866 aa  429  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  32.82 
 
 
925 aa  429  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
881 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
881 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 
884 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
867 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 
892 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
881 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 
880 aa  418  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  31.84 
 
 
860 aa  419  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  34.13 
 
 
880 aa  416  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 
880 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  32.38 
 
 
891 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
895 aa  415  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
881 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 
881 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  32.51 
 
 
885 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 
881 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  34.41 
 
 
880 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 
873 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  32.08 
 
 
881 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 
886 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
881 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
881 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
922 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
881 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  31.64 
 
 
881 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  31.83 
 
 
881 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 
881 aa  403  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 
883 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
880 aa  406  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 
883 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 
887 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  32.82 
 
 
872 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
883 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>