292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2497 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2497  PKD  100 
 
 
1531 aa  3105    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.81 
 
 
2554 aa  504  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.81 
 
 
1862 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  30.66 
 
 
812 aa  253  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  33.28 
 
 
801 aa  248  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.12 
 
 
1094 aa  241  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  25.2 
 
 
1230 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.78 
 
 
963 aa  227  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  33.17 
 
 
1667 aa  225  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  33.76 
 
 
561 aa  216  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  37.26 
 
 
752 aa  214  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.7 
 
 
1842 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  37.01 
 
 
2036 aa  209  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.12 
 
 
859 aa  207  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  26.55 
 
 
3295 aa  206  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  33.39 
 
 
1682 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  35.41 
 
 
1667 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33.76 
 
 
2272 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.54 
 
 
1361 aa  202  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  32.53 
 
 
941 aa  201  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  36.32 
 
 
1882 aa  199  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.35 
 
 
735 aa  196  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  38.42 
 
 
1300 aa  194  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  38.44 
 
 
1241 aa  194  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  35.55 
 
 
675 aa  193  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.81 
 
 
669 aa  192  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  34.03 
 
 
713 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.99 
 
 
1356 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.71 
 
 
679 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  32.9 
 
 
978 aa  185  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  30.69 
 
 
1532 aa  184  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  37.92 
 
 
1969 aa  184  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  35.21 
 
 
528 aa  182  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  36.16 
 
 
685 aa  179  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  36.92 
 
 
2000 aa  179  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  43.49 
 
 
910 aa  178  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  35.39 
 
 
575 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  39.7 
 
 
930 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  45.26 
 
 
581 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.48 
 
 
2122 aa  175  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  32.66 
 
 
1783 aa  173  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  35.89 
 
 
658 aa  173  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  30.6 
 
 
1528 aa  171  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.3 
 
 
1282 aa  171  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  37.59 
 
 
551 aa  170  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  43.53 
 
 
791 aa  170  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  41.34 
 
 
547 aa  169  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  39.31 
 
 
460 aa  167  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  41.49 
 
 
615 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.59 
 
 
1152 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  35.9 
 
 
1120 aa  164  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  31.6 
 
 
761 aa  163  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  34.26 
 
 
1236 aa  161  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.17 
 
 
1732 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  35.18 
 
 
530 aa  160  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  23.94 
 
 
1111 aa  154  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  32.41 
 
 
958 aa  154  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  32.05 
 
 
603 aa  152  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.57 
 
 
1387 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  27.78 
 
 
2176 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  46.11 
 
 
644 aa  147  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  32.66 
 
 
971 aa  147  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  46.11 
 
 
560 aa  142  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  50.94 
 
 
184 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  32.56 
 
 
838 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.88 
 
 
519 aa  138  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  45.4 
 
 
500 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  45.25 
 
 
816 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  32.77 
 
 
861 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.95 
 
 
1814 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  28.41 
 
 
1011 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  38.43 
 
 
930 aa  128  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  40.38 
 
 
823 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  27.97 
 
 
865 aa  125  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  45.16 
 
 
996 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  37.56 
 
 
819 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  34.02 
 
 
869 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  28.29 
 
 
952 aa  118  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  43.35 
 
 
1328 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  37.3 
 
 
1095 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.98 
 
 
1189 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  38.03 
 
 
777 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  37.04 
 
 
786 aa  117  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  32.83 
 
 
870 aa  116  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.83 
 
 
802 aa  115  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  37.9 
 
 
845 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  37.67 
 
 
848 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  36.97 
 
 
719 aa  113  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  42.24 
 
 
819 aa  112  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.92 
 
 
840 aa  112  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  32.75 
 
 
443 aa  111  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  39.9 
 
 
1231 aa  110  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  40 
 
 
400 aa  109  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  34.32 
 
 
1292 aa  108  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  40.91 
 
 
439 aa  108  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.96 
 
 
1620 aa  107  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.4 
 
 
938 aa  103  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.27 
 
 
1606 aa  102  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  42.95 
 
 
1931 aa  101  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  34.4 
 
 
1602 aa  98.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>