33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2488 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2488  30S ribosomal protein S6e  100 
 
 		 135 aa  270  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0462  30S ribosomal protein S6e  60.9 
 
 		 132 aa  167  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2295  30S ribosomal protein S6e  60.16 
 
 		 143 aa  160  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0338  30S ribosomal protein S6e  62.9 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.437813 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1519  30S ribosomal protein S6e  58.27 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.371322  normal  0.814112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0802  Ribosomal protein S6e  48.44 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3383  30S ribosomal protein S6e  50.83 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000095126  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0255  Ribosomal protein S6e  40.77 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.472307  hitchhiker  0.00887394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0224  30S ribosomal protein S6e  45.93 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0670  ribosomal protein S6e  46.28 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0127674  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0937  30S ribosomal protein S6e  38.4 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1318  Ribosomal protein S6e  44 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3407  Ribosomal protein S6e  41.22 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2128  Ribosomal protein S6e  44.64 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.864621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0422  ribosomal protein S6e  46.43 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0522  30S ribosomal protein S6e  40.34 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0383  30S ribosomal protein S6e  39.84 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0454  30S ribosomal protein S6e  39.84 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0821  30S ribosomal protein S6e  44.07 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1465  30S ribosomal protein S6e  38.58 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0200  30S ribosomal protein S6e  40.16 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101575  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1589  30S ribosomal protein S6e  41.53 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.416866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0626  30S ribosomal protein S6e  40.68 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.798108  normal  0.959135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0618  30S ribosomal protein S6e  39.32 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.407123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0071  30S ribosomal protein S6e  34.55 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1388  Ribosomal protein S6e  39.39 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0134  30S ribosomal protein S6e  33.05 
 
 		 150 aa  72  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2244  30S ribosomal protein S6e  40.21 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.587547  hitchhiker  0.00206613 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85801  ribosomal protein S6A (S10A) (rp9) (YS4)  37.29 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.950125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02780  40s ribosomal protein s6-b, putative  35.54 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18559  predicted protein  32.79 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0884469  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01964  40S ribosomal protein S6 (AFU_orthologue; AFUA_4G10800)  36.97 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2296  hypothetical protein  52.38 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>