More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2453 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  54.91 
 
 		 224 aa  261  8e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  51.38 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  54.17 
 
 		 226 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  53.02 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  43.18 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  39.63 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  39.17 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  38.39 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  38.22 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  36.94 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  33.19 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  30.6 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  35.65 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  34.86 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  33.94 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  35.24 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  33.49 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  35.05 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  31.4 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  31.17 
 
 		 330 aa  99.4  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  30.3 
 
 		 332 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  31.22 
 
 		 324 aa  98.2  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  30.3 
 
 		 330 aa  97.8  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  29.44 
 
 		 333 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  29.82 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  28.39 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  30.74 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  30.84 
 
 		 343 aa  78.6  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  29.69 
 
 		 348 aa  78.2  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  28.11 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  28.11 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.87 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  29.47 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  27.4 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  30.32 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  28.11 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  27.09 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  29.96 
 
 		 329 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  28.19 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  25.7 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  26.18 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  25.3 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0131  recombinase A  26.27 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0296  recA protein  26.56 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.197187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  26.1 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  27.64 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  27.6 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  27.6 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  24.78 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  27.6 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  24.78 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  25.45 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  28.31 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  27.6 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  28.31 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  25.82 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  27.67 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  25.1 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  26.34 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  25.97 
 
 		 414 aa  62.8  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  26.51 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  27.18 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1158  recombinase A  27.27 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  35.16 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3732  recA protein  28.25 
 
 		 358 aa  62  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000212043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  35.16 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  24.79 
 
 		 356 aa  62  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  26.7 
 
 		 343 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  28.89 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.3 
 
 		 217 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  27.18 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  27.18 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  28.33 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  26.23 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  27.05 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  26.53 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  27.12 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  27.16 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  26.87 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  27.93 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  34.38 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  34.38 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1195  recombinase A  26.91 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.111178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  26.25 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  26.25 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  26.51 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  26.21 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  26.1 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  27.03 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  25.82 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  29.05 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  27.93 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  26.51 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2110  DNA repair protein RadA  27.23 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  28.76 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  26.51 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  25.51 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  27.06 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>