More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2316 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  61.68 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  59.41 
 
 		 272 aa  329  4e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  57.88 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  60.44 
 
 		 274 aa  314  8e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  58.09 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  39.12 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  38.95 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  40.94 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  35.92 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  39.16 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  37.19 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 368 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  34.64 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 279 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.97 
 
 		 334 aa  156  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  38.51 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 		 279 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 281 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  37.15 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.67 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 292 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 292 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  35.96 
 
 		 292 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  36.84 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  34.8 
 
 		 286 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  36.49 
 
 		 407 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  35.97 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  35.91 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  36.53 
 
 		 268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  36.67 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  34.26 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>