52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2275 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  54.67 
 
 
184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  54.79 
 
 
159 aa  158  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  50.67 
 
 
164 aa  146  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  52.74 
 
 
166 aa  140  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  47.02 
 
 
155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  44 
 
 
156 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  46.94 
 
 
160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  41.45 
 
 
606 aa  125  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  41.45 
 
 
164 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  42.95 
 
 
161 aa  97.8  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2274  PUA domain-containing protein  38.78 
 
 
172 aa  94.4  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.112054  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  37.65 
 
 
176 aa  94.4  6e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  37.75 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  35.56 
 
 
189 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  31.79 
 
 
649 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.46 
 
 
649 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.33 
 
 
649 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  31.76 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.57 
 
 
649 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2177  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  38.1 
 
 
582 aa  65.5  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.881691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  33.61 
 
 
652 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1772  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  33.33 
 
 
615 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  33.62 
 
 
633 aa  62  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0956  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  33.1 
 
 
626 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  32.74 
 
 
580 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2157  PUA domain containing protein  37.66 
 
 
600 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.516872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  28.97 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  30.56 
 
 
161 aa  57.4  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0714  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  36.3 
 
 
585 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  27.5 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0907  PUA domain-containing protein  28.77 
 
 
539 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.392751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1488  PUA domain-containing protein  33.33 
 
 
602 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1661  PUA domain-containing protein  35.14 
 
 
566 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2683  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  33.56 
 
 
608 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0105473  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  33.04 
 
 
634 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  28.36 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  24.82 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1814  PUA domain-containing protein  30.97 
 
 
538 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1433  PUA domain containing protein  30.82 
 
 
590 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0842  PUA domain-containing protein  30.09 
 
 
538 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.450435  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0894  putative RNA-binding protein  29.82 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1075  PUA domain-containing protein  30.09 
 
 
538 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1052  putative RNA-binding protein  29.82 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  28.24 
 
 
481 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0859  PUA domain containing protein  32.47 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1622  putative RNA-binding protein  28.95 
 
 
159 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  32.31 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1070  putative RNA-binding protein  28.07 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1119  hypothetical protein  44.26 
 
 
546 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0607  PUA domain-containing protein  37.25 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398767  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0187  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 
182 aa  40.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.164095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>