More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2249 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2249  30S ribosomal protein S19P  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000080677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0446  30S ribosomal protein S19P  75.91 
 
 		 137 aa  223  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0104609  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0536  30S ribosomal protein S19P  72.59 
 
 		 139 aa  209  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0568  30S ribosomal protein S19P  70.8 
 
 		 137 aa  206  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00394395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0085  30S ribosomal protein S19P  64.23 
 
 		 136 aa  190  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.316285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0106  30S ribosomal protein S19P  58.39 
 
 		 136 aa  167  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.346057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1724  30S ribosomal protein S19P  57.66 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00713726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0005  30S ribosomal protein S19P  50.36 
 
 		 137 aa  156  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  1.96004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1517  ribosomal protein S19  49.21 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  8.41136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1832  30S ribosomal protein S19P  50.39 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2222  ribosomal protein S19  52.27 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2445  30S ribosomal protein S19P  49.62 
 
 		 141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0214  ribosomal protein S19  51.88 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2296  30S ribosomal protein S19P  51.16 
 
 		 141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0225  30S ribosomal protein S19P  51.85 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.386417  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0795  30S ribosomal protein S19P  46.53 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0933963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1123  30S ribosomal protein S19P  47.22 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.325514  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0803  30S ribosomal protein S19P  45.26 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0029  30S ribosomal protein S19P  45.83 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0917309  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1774  ribosomal protein S19  40.44 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05997  40S ribosomal protein S15 (Broad)  44.14 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0806  30S ribosomal protein S19P  44.19 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.345007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0861  30S ribosomal protein S19P  44.53 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.222615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0095  30S ribosomal protein S19P  38.97 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000607429  unclonable  0.000000387819 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0774  30S ribosomal protein S19P  42.65 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0627  30S ribosomal protein S19P  43.38 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1705  30S ribosomal protein S19P  41.91 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0143251 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0724  30S ribosomal protein S19P  41.91 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.888673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0515  30S ribosomal protein S19P  41.27 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.319488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26849  predicted protein  39.26 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.624783  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03840  40s ribosomal protein s15, putative  37.14 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39331  predicted protein  38.3 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66616  predicted protein  35.62 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.428527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1840  ribosomal protein S19  40.79 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000159969  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl127  30S ribosomal protein S19  43.75 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.959026  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57474  predicted protein  39.68 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.576492  normal  0.012106 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0287  30S ribosomal protein S19  46.27 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0589679  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0692  30S ribosomal protein S19  42.25 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  39.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  48.15 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  37.84 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  39.73 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01950  mitochondrial ribosomal protein s19, putative  37.18 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0771  30S ribosomal protein S19  42.86 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0231426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  40.32 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  41.18 
 
 		 91 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  43.86 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  42.19 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  44.07 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0207  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.62728  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  47.92 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0260  30S ribosomal protein S19  50 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0498  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000587153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1230  30S ribosomal protein S19  44.9 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  37.68 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  41.67 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0493  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0269  30S ribosomal protein S19  34.62 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031867  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0437  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00413401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  38.89 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  41.89 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1349  30S ribosomal protein S19  40.98 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  45.28 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0425  SSU ribosomal protein S19P  39.34 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443512  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  45.28 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  35.14 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  45.45 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  43.64 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  45.16 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  38.03 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0222  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0677  30S ribosomal protein S19  37.04 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.082813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  36.23 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1151  30S ribosomal protein S19  35.21 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000597643  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf439  30S ribosomal protein S19  43.64 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  37.1 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  44.44 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  47.92 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  47.92 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  45.83 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  40.32 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  40.32 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  37.31 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0430  30S ribosomal protein S19  38.81 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377773  decreased coverage  0.00000532224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  40.98 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  41.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>