107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2248 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 154 aa  314  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  61.84 
 
 		 156 aa  201  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  60.53 
 
 		 154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  60.93 
 
 		 153 aa  190  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  52.26 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 152 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  47.68 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  47.68 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  47.68 
 
 		 153 aa  153  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  46.36 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  46.36 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  45.7 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  41.5 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  42.47 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  42.57 
 
 		 185 aa  123  8.000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  41.06 
 
 		 151 aa  120  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  39.46 
 
 		 198 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  44 
 
 		 185 aa  117  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  39.46 
 
 		 185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  40.13 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  38.85 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  39.1 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  35.1 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  38.35 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  35.71 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  36.05 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  39.53 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.17 
 
 		 183 aa  77  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  33.79 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  33.57 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  32.06 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  31.15 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  40.85 
 
 		 114 aa  51.2  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  37.5 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  27.69 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  29.23 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  37.5 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  38.89 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  25.95 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  28.46 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  24.11 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  27.78 
 
 		 125 aa  44.3  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  34.72 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  27.34 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  28.47 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  34.12 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  34.25 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  25.78 
 
 		 113 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  37.5 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  31.51 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  31.51 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  30.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  30.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  30.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  30.1 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  30.1 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  26.15 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  31.94 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  31.94 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  31.94 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  31.43 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  31.46 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  30.99 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  32.31 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  25.93 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1941  50S ribosomal protein L22  27.56 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  27.45 
 
 		 311 aa  40.4  0.008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>