More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2190 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  100 
 
 
119 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  77.31 
 
 
119 aa  190  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1522  hypothetical protein  75.63 
 
 
126 aa  185  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.181711  normal  0.471635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  69.75 
 
 
119 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
118 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3663  MarR family transcriptional regulator  54.87 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.4155  decreased coverage  0.00589619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1282  transcriptional regulator, HxlR family  45.16 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1471  transcriptional regulator, HxlR family  42.86 
 
 
108 aa  77  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  40.82 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7868  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
121 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2224  transcriptional regulator, HxlR family  38.38 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.647927  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2595  transcriptional regulator  38.38 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4048  HxlR family transcriptional regulator  39 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  37.25 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  49.46 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0608  transcriptional regulator, HxlR family  37.27 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607551  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3399  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0796  hypothetical protein  44.79 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0836  hypothetical protein  44.79 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.126369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0929  hypothetical protein  44.79 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0745  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000483022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0740  MarR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0154  transcriptional regulator  43.48 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2499  transcriptional regulator, HxlR family  38.68 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0968705  normal  0.226529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0891  hypothetical protein  43.75 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0931  hypothetical protein  44.79 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.480340000000001e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0748  HxlR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4443  transcriptional regulator, MarR family  44.79 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.937867  normal  0.431407 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3098  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  34.51 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1143  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.553828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  40.21 
 
 
110 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1091  HxlR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000172182  normal  0.0223726 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0113  HxlR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0906  HxlR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.278894  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1698  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.171254  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0998  HxlR family transcriptional regulator  37 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396575 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4874  transcriptional regulator  43.82 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4889  transcriptional regulator  43.82 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2294  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107881  normal  0.103763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2088  HxlR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.203524  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  30.97 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5302  hypothetical protein  43.82 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5315  hypothetical protein  43.82 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5044  hypothetical protein  43.82 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3732  HxlR family transcriptional regulator  43.82 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00142315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5284  hypothetical protein  43.82 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000956827 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5428  hypothetical protein  43.82 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5643  hypothetical protein  43.82 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00272116  hitchhiker  0.0000000000000412224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5360  hypothetical protein  43.82 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3513  HxlR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1135  transcriptional regulator, HxlR family  38.83 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4104  transcriptional regulator, HxlR family  33.67 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0945  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  37.62 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2640  transcriptional regulator, HxlR family  38.78 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.954281  normal  0.0406571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4262  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388354  normal  0.116604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1000  hypothetical protein  43.88 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0590382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1021  hypothetical protein  43.88 
 
 
114 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4989  HxlR family transcriptional regulator  42.7 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3585  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000738633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  35.42 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  36.84 
 
 
159 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5548  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3738  transcriptional regulator, HxlR family  38.53 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1876  HxlR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3282  transcriptional regulator, HxlR family  33.67 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  32.71 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  37.25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  37.25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3564  HxlR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  34.74 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  37.25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0348  HxlR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5429  transcriptional regulator, HxlR family  32.99 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  32.69 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0014  transcriptional regulator, HxlR family  35.35 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000846639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3168  transcriptional regulator, HxlR family  39.53 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4287  transcriptional regulator, HxlR family  33 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.235494 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3293  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0763403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
117 aa  65.1  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1661  HxlR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2092  HxlR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
216 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821202  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1227  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.916879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  38.95 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  33.65 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  33.91 
 
 
128 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4243  transcriptional regulator, HxlR family  33.33 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.790353  normal  0.125727 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2370  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.132848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1032  HxlR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
227 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>