More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2182 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  100 
 
 
316 aa  630  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  67.95 
 
 
308 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  65.38 
 
 
309 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  59.24 
 
 
311 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  62.82 
 
 
309 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  65.06 
 
 
308 aa  371  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  63.38 
 
 
311 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  65.81 
 
 
309 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  64.52 
 
 
309 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  61.86 
 
 
308 aa  358  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  61.41 
 
 
309 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  57.19 
 
 
311 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  58.93 
 
 
317 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  61.09 
 
 
319 aa  351  8.999999999999999e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  59.22 
 
 
308 aa  350  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  60.65 
 
 
309 aa  351  1e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  59.35 
 
 
309 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  59.29 
 
 
308 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  57.05 
 
 
317 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  59.03 
 
 
309 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  61.29 
 
 
311 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  60.97 
 
 
311 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  59.94 
 
 
309 aa  346  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  61.41 
 
 
320 aa  345  6e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  61.41 
 
 
330 aa  345  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  58.39 
 
 
309 aa  344  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60 
 
 
339 aa  344  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  60.9 
 
 
309 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  61.17 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  57.64 
 
 
317 aa  342  4e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  56.74 
 
 
316 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  61.41 
 
 
320 aa  342  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  62.38 
 
 
320 aa  342  7e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  55.16 
 
 
311 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  59.62 
 
 
311 aa  340  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  58.73 
 
 
308 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  62.94 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  55.95 
 
 
312 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  58.28 
 
 
317 aa  339  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  61.54 
 
 
311 aa  339  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  59.81 
 
 
320 aa  338  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  58.97 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  61.09 
 
 
320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  60.77 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  63.23 
 
 
310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  61.09 
 
 
309 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  55.48 
 
 
312 aa  334  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  60.77 
 
 
320 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  60.77 
 
 
309 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  58.01 
 
 
311 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  59.35 
 
 
319 aa  332  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  61.61 
 
 
311 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  56.45 
 
 
309 aa  330  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  57.61 
 
 
308 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  59.15 
 
 
320 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  60.32 
 
 
328 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  56.69 
 
 
317 aa  329  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  60.45 
 
 
321 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  56.77 
 
 
308 aa  328  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04051  O-acetylserine (thiol)-lyase A  57.68 
 
 
328 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  54.52 
 
 
304 aa  328  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  59.15 
 
 
320 aa  328  7e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  57.88 
 
 
322 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  59.35 
 
 
311 aa  328  8e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  57.68 
 
 
322 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  60.58 
 
 
311 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  57.1 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  57.1 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  56.77 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  57.69 
 
 
311 aa  326  3e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0973  cysteine synthase A  57.23 
 
 
326 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0856961  normal  0.0511521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0937  cysteine synthase A  57.23 
 
 
326 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.251918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  56.45 
 
 
324 aa  325  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  58.71 
 
 
309 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2701  cysteine synthase A  57.19 
 
 
323 aa  325  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000531344  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  61.41 
 
 
334 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  58.01 
 
 
311 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2903  cysteine synthase A  56.11 
 
 
322 aa  324  9e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  57.01 
 
 
314 aa  324  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  57.64 
 
 
327 aa  324  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  57.42 
 
 
310 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2468  cysteine synthase A  55.97 
 
 
321 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0868534  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  53.65 
 
 
324 aa  324  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02314  cysteine synthase A, O-acetylserine sulfhydrolase A subunit  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000113698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1247  cysteine synthase A  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000402338  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  57.98 
 
 
320 aa  323  2e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2569  cysteine synthase A  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00204709  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2766  cysteine synthase A  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02275  hypothetical protein  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2520  cysteine synthase A  55.17 
 
 
322 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  59.49 
 
 
323 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1264  cysteine synthase A  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000422758  decreased coverage  0.000025009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2549  cysteine synthase A  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000853816  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3645  cysteine synthase A  56.88 
 
 
323 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00108358  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3690  cysteine synthase A  56.11 
 
 
323 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0913  cysteine synthase A  56.91 
 
 
325 aa  323  3e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  59.29 
 
 
320 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2356  cysteine synthase A  56.11 
 
 
322 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  58.52 
 
 
329 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0178  cysteine synthase A  56.77 
 
 
316 aa  322  6e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0627608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>