More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2088 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 323 aa  675    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0631  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  36.42 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0604  periplasmic solute binding protein  38.03 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_572  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  36.62 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  37.17 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  37.54 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  34.22 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  35.76 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  37.01 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  36.36 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  37.91 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  34.35 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 292 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  37.06 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  33.89 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  35.07 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  34.22 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  33.33 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  34.3 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  33.59 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  36.57 
 
 		 344 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.57 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  32.38 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  34.83 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1725  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0025  periplasmic solute binding protein  31.36 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  30.92 
 
 		 302 aa  160  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  29.8 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0024  periplasmic solute binding protein  32.48 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal  0.178577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2208  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  32.14 
 
 		 345 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.353615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3026  ABC-type transport system, periplasmic component  30.77 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.88 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0138  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.81 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1759  adhesion protein, putative  27.55 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0179  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.47 
 
 		 296 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0156  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.62 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  30.15 
 
 		 332 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.67 
 
 		 514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  31.14 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  28.62 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  29.74 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  29.33 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  29.71 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  30.22 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.5 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.5 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.5 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  29.86 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.5 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3805  periplasmic solute binding protein  23.68 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0163421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  26.56 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.12 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  30.28 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.58 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.22 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  28.93 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  28.93 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  28.38 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  28.24 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  26.76 
 
 		 506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  28.03 
 
 		 302 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  25.2 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  27.38 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  29.35 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0039  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.78 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  28.21 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  25.38 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  23.99 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  26.21 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  27.62 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  30.26 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  29.18 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  28.22 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  25.76 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0500  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000159961  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1731  periplasmic solute binding protein  32.48 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  23.98 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.18 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  32.26 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  28.42 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  27.89 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  29.36 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  27.8 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>