238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2065 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2065  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
484 aa  1003    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6289  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 
510 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00968377  normal  0.473682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3726  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  33.4 
 
 
586 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
500 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  33.87 
 
 
500 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0939  amine oxidase  32.59 
 
 
496 aa  263  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  34.34 
 
 
523 aa  261  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2408  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 
563 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410244  normal  0.0736984 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1763  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
498 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  26.34 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  24.57 
 
 
503 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  25.68 
 
 
503 aa  126  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  24.04 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  24.61 
 
 
507 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  24.46 
 
 
505 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  23.45 
 
 
503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  24.65 
 
 
520 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 
515 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.42 
 
 
544 aa  106  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  24.39 
 
 
506 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.72 
 
 
740 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  22 
 
 
512 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  22 
 
 
512 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  24.9 
 
 
512 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  27.14 
 
 
523 aa  103  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  24.29 
 
 
504 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 
512 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  25.65 
 
 
501 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  23.73 
 
 
520 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  23.35 
 
 
513 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  21.72 
 
 
938 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  24.76 
 
 
509 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  23.63 
 
 
496 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  22.22 
 
 
506 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.66 
 
 
516 aa  95.1  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1209  conserved hypothetical protein, FAD-binding domain protein  22.69 
 
 
502 aa  94.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  24.95 
 
 
509 aa  93.6  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 
717 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 
497 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  23.06 
 
 
497 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  23.52 
 
 
509 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  23.27 
 
 
520 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  24.13 
 
 
554 aa  91.7  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  24.08 
 
 
511 aa  90.9  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  22.11 
 
 
506 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  22.88 
 
 
518 aa  90.9  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  23.94 
 
 
598 aa  90.5  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  25.97 
 
 
508 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  23.12 
 
 
509 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  23.52 
 
 
509 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  23.08 
 
 
509 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  23.23 
 
 
518 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  24.63 
 
 
711 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  23.66 
 
 
504 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  21.43 
 
 
532 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  23.82 
 
 
518 aa  86.7  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
722 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  22.86 
 
 
552 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  22.89 
 
 
549 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  22.51 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  21.53 
 
 
514 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  24.15 
 
 
514 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  23.03 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  23.2 
 
 
514 aa  83.2  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  22.7 
 
 
498 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  24.65 
 
 
542 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.61 
 
 
511 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5970  FAD dependent oxidoreductase  21.6 
 
 
534 aa  80.9  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  22.27 
 
 
511 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1896  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 
73 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  22.83 
 
 
489 aa  80.5  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  23.83 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  22.95 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  25.27 
 
 
708 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  23.3 
 
 
514 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  25.15 
 
 
645 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  24.03 
 
 
505 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  21.94 
 
 
507 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  23.53 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  24.12 
 
 
518 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  26.24 
 
 
516 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  24.12 
 
 
518 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  21.11 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  23.88 
 
 
504 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  21.84 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  24.05 
 
 
524 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.31 
 
 
511 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  22.38 
 
 
510 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  23.09 
 
 
556 aa  73.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  22.16 
 
 
595 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  22.69 
 
 
508 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  24.91 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  22.37 
 
 
505 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.76 
 
 
556 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  22.8 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  22.96 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2352  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 
495 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  22.3 
 
 
553 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>