More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2045 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 199 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 3145 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  29.84 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.99 
 
 		 632 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 716 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 467 aa  58.9  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 699 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  30.53 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  23.61 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 762 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 611 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 878 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 311 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.5 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 767 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 4079 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 543 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.77 
 
 		 1013 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 927 aa  55.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34 
 
 		 586 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.17 
 
 		 620 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 1127 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.17 
 
 		 397 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 635 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 635 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.44 
 
 		 1694 aa  54.7  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 620 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 512 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 326 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  26.09 
 
 		 656 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 446 aa  54.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  29.7 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 363 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 688 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 465 aa  53.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  41.54 
 
 		 687 aa  53.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 637 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 363 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.85 
 
 		 810 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 685 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1827 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0120  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 		 555 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 718 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  30 
 
 		 762 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 566 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30 
 
 		 762 aa  52.4  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 612 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  35.62 
 
 		 564 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.89 
 
 		 462 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 636 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 393 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 639 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.53 
 
 		 708 aa  52  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1112 aa  52  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  32.22 
 
 		 661 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 		 1067 aa  51.6  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.21 
 
 		 439 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 169 aa  51.6  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 265 aa  51.2  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.21 
 
 		 439 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 220 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  23.78 
 
 		 1004 aa  51.2  0.000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.04 
 
 		 289 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  34.41 
 
 		 566 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 626 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.69 
 
 		 1979 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1297 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 626 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.95 
 
 		 358 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.61 
 
 		 626 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 356 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.09 
 
 		 836 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 393 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.35 
 
 		 614 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 750 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 468 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.61 
 
 		 561 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 		 1737 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1965  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0650389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.29 
 
 		 292 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.22 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1094 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.17 
 
 		 622 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.61 
 
 		 561 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77798  predicted protein  24.67 
 
 		 605 aa  50.1  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>