More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1939 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  100 
 
 
410 aa  831  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  54.38 
 
 
416 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  45.01 
 
 
403 aa  339  7e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  45.45 
 
 
405 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.43 
 
 
403 aa  317  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  43.22 
 
 
403 aa  317  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  41.48 
 
 
403 aa  310  3e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  43.8 
 
 
403 aa  305  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  43 
 
 
402 aa  304  2e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  43.8 
 
 
403 aa  303  5e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  42.03 
 
 
402 aa  298  9e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  4.60563e-06 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  41.27 
 
 
403 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  45.81 
 
 
402 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  43.15 
 
 
401 aa  292  8e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  42.41 
 
 
401 aa  292  9e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  41.56 
 
 
404 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  41.22 
 
 
403 aa  289  5e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  46.15 
 
 
401 aa  289  6e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  42.26 
 
 
395 aa  289  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  46.15 
 
 
401 aa  289  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  40.97 
 
 
403 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  44.25 
 
 
402 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.46 
 
 
400 aa  287  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  40.26 
 
 
403 aa  284  2e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  38.62 
 
 
402 aa  283  3e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  45.79 
 
 
402 aa  283  4e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  39.53 
 
 
403 aa  283  4e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  42.82 
 
 
400 aa  282  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.44 
 
 
407 aa  280  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  38.27 
 
 
403 aa  280  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  45.41 
 
 
404 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.39723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  45.15 
 
 
403 aa  278  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  38.87 
 
 
402 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  39.53 
 
 
403 aa  278  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  43.6 
 
 
402 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  39.28 
 
 
403 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  39.28 
 
 
403 aa  276  6e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  45.13 
 
 
402 aa  276  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  43.26 
 
 
418 aa  276  7e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.47 
 
 
402 aa  274  2e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.64 
 
 
403 aa  273  4e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  43.48 
 
 
402 aa  273  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  44.57 
 
 
408 aa  272  9e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  43.48 
 
 
402 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.79 
 
 
415 aa  268  9e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  41.09 
 
 
412 aa  266  3e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  40.9 
 
 
409 aa  266  6e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.58 
 
 
414 aa  265  9e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.85 
 
 
400 aa  265  9e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  41.01 
 
 
399 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  39.9 
 
 
398 aa  263  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  42.54 
 
 
413 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  43.14 
 
 
402 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  41.23 
 
 
410 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.05 
 
 
412 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  42.3 
 
 
401 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  40.81 
 
 
411 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  39.95 
 
 
406 aa  255  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  43.8 
 
 
405 aa  254  2e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.45 
 
 
415 aa  252  8e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  3.23756e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  40.1 
 
 
408 aa  251  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  37.97 
 
 
402 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  44.88 
 
 
403 aa  251  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  39.55 
 
 
402 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  39.95 
 
 
415 aa  252  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  42.52 
 
 
410 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  44.17 
 
 
411 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  40.15 
 
 
404 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  2.83159e-06 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  38.44 
 
 
537 aa  248  1e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  41.79 
 
 
412 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  41.46 
 
 
415 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.41 
 
 
404 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  42.21 
 
 
406 aa  246  7e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  39.65 
 
 
411 aa  246  7e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  41.9 
 
 
399 aa  244  2e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  38.21 
 
 
403 aa  244  2e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  41.9 
 
 
399 aa  244  2e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  40.31 
 
 
403 aa  244  2e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.12424e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  40.1 
 
 
408 aa  243  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  42.42 
 
 
422 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  41.1 
 
 
415 aa  243  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  40.97 
 
 
415 aa  242  8e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  39.64 
 
 
403 aa  242  9e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  36.16 
 
 
406 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.48333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  39.85 
 
 
404 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  41.97 
 
 
443 aa  239  6e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  42.67 
 
 
412 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  41.22 
 
 
402 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  39.54 
 
 
398 aa  237  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  38.96 
 
 
412 aa  236  5e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  45.28 
 
 
346 aa  235  1e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  41.98 
 
 
410 aa  235  1e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  37.66 
 
 
416 aa  235  1e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  45.28 
 
 
346 aa  235  1e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  41.62 
 
 
403 aa  234  2e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  39.14 
 
 
413 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  39.33 
 
 
412 aa  232  7e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  39.4 
 
 
421 aa  233  7e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  39.06 
 
 
405 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  38.73 
 
 
415 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>