100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1715 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1715  xylose isomerase-like TIM barrel  100 
 
 		 256 aa  533  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.436698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1592  xylose isomerase domain-containing protein  58.04 
 
 		 257 aa  325  6e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.234456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1555  xylose isomerase domain-containing protein  56.47 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1974  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  55.16 
 
 		 256 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1364  hypothetical protein  48.24 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000110599  hitchhiker  0.0000000254981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0361  xylose isomerase domain-containing protein  38.65 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.934654  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0973  hypothetical protein  38.58 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2151  xylose isomerase-like TIM barrel  38.25 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00601378  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1257  xylose isomerase domain-containing protein  35.37 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.666664  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0027  xylose isomerase domain-containing protein  34.31 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.0054119  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1121  xylose isomerase domain-containing protein  33.61 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0863  xylose isomerase domain-containing protein  33.6 
 
 		 268 aa  122  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0797  xylose isomerase domain-containing protein  32.77 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0606735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1299  xylose isomerase domain-containing protein  34.76 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.47167  normal  0.0132415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0036  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.86 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.875943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0740  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  30.73 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.103383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0122  xylose isomerase domain-containing protein  25.33 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.668761  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1143  xylose isomerase domain-containing protein  29.89 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0174  xylose isomerase domain-containing protein  31.31 
 
 		 236 aa  96.3  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0871  hypothetical protein  28.23 
 
 		 241 aa  95.5  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00496229  hitchhiker  0.00660497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0600  xylose isomerase domain-containing protein  31.72 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0442  hypothetical protein  27.54 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.25 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1379  hypothetical protein  30.12 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.100757  normal  0.0567681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3371  AP endonuclease  29.3 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1528  xylose isomerase-like TIM barrel  29.66 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.317464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3793  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.7 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2972  xylose isomerase domain-containing protein  28.31 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1494  xylose isomerase domain-containing protein  27.49 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1263  hypothetical protein  32.29 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3876  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.79 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.883338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4159  xylose isomerase domain-containing protein  27.67 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3128  hypothetical protein  30.88 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1398  xylose isomerase-like TIM barrel  28.43 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0655  AP endonuclease  26.57 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0064  xylose isomerase-like TIM barrel  24.88 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0474  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.47 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2460  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.2 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0967776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0988  xylose isomerase domain-containing protein  26.06 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.279783 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0270  xylose isomerase domain-containing protein  23.11 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.757164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0499  xylose isomerase domain-containing protein  26.84 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00421742  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0984  xylose isomerase domain-containing protein  23.11 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.221697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2404  xylose isomerase domain-containing protein  28.12 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2599  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3010  xylose isomerase-like TIM barrel  30 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4701  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.01 
 
 		 290 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4598  xylose isomerase-like TIM barrel  23.7 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1981  xylose isomerase domain-containing protein  24.33 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0319  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  22.77 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0247  xylose isomerase domain-containing protein TIM barrel  25.47 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4045  xylose isomerase domain-containing protein  23.95 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1644  xylose isomerase domain-containing protein  23.72 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.960602 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1279  hypothetical protein  24.89 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.393575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4027  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.68 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.383869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4546  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.14 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1458  xylose isomerase domain-containing protein  31.03 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2341  endonuclease IV  25 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257743  normal  0.0125203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3693  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.74 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0529  xylose isomerase-like TIM barrel  26.04 
 
 		 281 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0189964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3105  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.68 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3029  xylose isomerase-like TIM barrel  26.17 
 
 		 265 aa  48.9  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.599496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1978  xylose isomerase domain-containing protein  24.78 
 
 		 274 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0530  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.48 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.967129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0531  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.08 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0975  xylose isomerase domain-containing protein  25.66 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000320481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0511  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.95 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1892  xylose isomerase domain-containing protein  25.66 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0023  xylose isomerase domain-containing protein  25.12 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140146  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2522  xylose isomerase domain-containing protein  24.55 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4163  xylose isomerase domain-containing protein  27.97 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0983  hypothetical protein  23.29 
 
 		 245 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00469912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0949  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.86 
 
 		 272 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03175  hypothetical protein  24.46 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4684  fructoselysine 3-epimerase  24.46 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3842  fructoselysine 3-epimerase  24.46 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3568  fructoselysine 3-epimerase  24.46 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0509  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.42 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.440598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2030  xylose isomerase domain-containing protein  24.17 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0883  xylose isomerase domain-containing protein  26.17 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.32348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0340  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.46 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03223  predicted isomerase  24.46 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3750  fructoselysine 3-epimerase  24.46 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238004  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0440  xylose isomerase-like TIM barrel  25.71 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292372  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2883  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  24.33 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.384344  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5503  hypothetical protein  24.26 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2110  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  21.84 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517822  normal  0.355951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2851  xylose isomerase domain-containing protein  22.67 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01302  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2806  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.36 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1429  AP endonuclease  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01291  predicted enzyme  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2332  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1524  AP endonuclease  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0995  xylose isomerase-like TIM barrel  22.93 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1959  AP endonuclease, family 2  24.48 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0839995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0830  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.67 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.801774  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0340  fructoselysine 3-epimerase  24.03 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.452792 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4185  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.3 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0666  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.5 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3766  xylose isomerase domain-containing protein  21.54 
 
 		 306 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>