27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1489 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1489  DNA primase large subunit  100 
 
 
384 aa  798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0793  DNA primase large subunit  45.1 
 
 
338 aa  309  5e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0232424  normal  0.488052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1462  DNA primase large subunit  44.41 
 
 
334 aa  293  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1393  DNA primase large subunit  43.05 
 
 
362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.402871  normal  0.321171 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1252  DNA primase large subunit  36.01 
 
 
354 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2192  DNA primase large subunit  31.99 
 
 
364 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0880  DNA primase large subunit  30.86 
 
 
413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1028  DNA primase large subunit  34.72 
 
 
330 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0159  DNA primase, large subunit  31.56 
 
 
360 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0993  DNA primase, large subunit  38.12 
 
 
362 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.438183  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2038  DNA primase, large subunit  37.19 
 
 
427 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1650  DNA primase large subunit  30.14 
 
 
361 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1229  DNA primase, large subunit  36.53 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0852  DNA primase large subunit  29.79 
 
 
349 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.10596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1401  DNA primase large subunit  33.62 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0952  DNA primase large subunit  30.52 
 
 
346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0623  DNA primase, large subunit  27.56 
 
 
356 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.426261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0065  DNA primase large subunit  21.97 
 
 
341 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1917  DNA primase large subunit  26.88 
 
 
349 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2529  DNA primase, large subunit  28.1 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.436606  normal  0.303957 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0829  DNA primase, large subunit  29.73 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1211  DNA primase, large subunit  24.21 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.676025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0940  DNA primase, large subunit  25.09 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.410078  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1006  DNA primase, large subunit  23.22 
 
 
369 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1675  DNA primase large subunit  23.22 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1167  DNA primase, large subunit  23.37 
 
 
373 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1625  DNA primase, large subunit  19.94 
 
 
307 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>