280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1451 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
161 aa  328  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0646  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0994955  normal  0.0342956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
159 aa  77  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  30.83 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3565  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 
220 aa  63.9  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
141 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0629  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000664283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0659  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0497  transcriptional regulator  32.18 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.557364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  27.74 
 
 
147 aa  60.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
139 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1859  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
183 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000190016  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0802  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.495252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0820  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9124400000000003e-54 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0708  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0652  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0895094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0744  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0751713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1029  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
140 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0259  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0651  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.243525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0899  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0814  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  29.17 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  24.37 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2550  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313861 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
139 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  30.09 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4529  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.531118  normal  0.188029 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
149 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
159 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
140 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0343  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  22.96 
 
 
146 aa  51.6  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
145 aa  50.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  25.44 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  29.76 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>