More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1415 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  56.71 
 
 
1399 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
2072 aa  4285    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.51 
 
 
1758 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.47 
 
 
1055 aa  539  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  32.15 
 
 
1265 aa  460  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
1276 aa  305  5.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
862 aa  298  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
619 aa  296  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29.67 
 
 
1182 aa  290  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 
813 aa  283  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
608 aa  278  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
844 aa  259  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
655 aa  258  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
1341 aa  254  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.1 
 
 
1047 aa  253  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
1047 aa  250  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
732 aa  249  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
931 aa  246  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  37.89 
 
 
945 aa  245  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
841 aa  240  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
1325 aa  238  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2213  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
1069 aa  236  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.273979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
763 aa  235  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
1032 aa  234  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
769 aa  234  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
653 aa  234  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 
1222 aa  234  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
968 aa  233  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  39.13 
 
 
936 aa  232  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
721 aa  230  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  38.37 
 
 
479 aa  229  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
768 aa  229  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1140  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
563 aa  228  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
1439 aa  228  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
1255 aa  226  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
720 aa  226  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
603 aa  225  7e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
1301 aa  225  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
472 aa  222  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1307  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
1225 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.551936  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
736 aa  220  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.6 
 
 
814 aa  215  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  47.5 
 
 
800 aa  214  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
1078 aa  214  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
1050 aa  213  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
651 aa  211  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
813 aa  210  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
1039 aa  207  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1104  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
569 aa  207  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.53532  normal  0.324425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
596 aa  207  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
1039 aa  205  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
901 aa  204  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
873 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
783 aa  204  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
1111 aa  202  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
657 aa  202  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
1121 aa  199  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
581 aa  198  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
1426 aa  197  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
968 aa  197  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
619 aa  196  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
1177 aa  195  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0467  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
431 aa  194  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.466167  hitchhiker  0.00940458 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
781 aa  194  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0157  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
478 aa  192  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.260977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
771 aa  193  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
1425 aa  192  5e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  41 
 
 
1251 aa  192  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
931 aa  191  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0358  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
571 aa  190  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213349  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
472 aa  190  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
909 aa  189  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
566 aa  189  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.866363 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
765 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
593 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
481 aa  186  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0656222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  24.16 
 
 
1239 aa  186  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
656 aa  185  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
644 aa  184  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
559 aa  183  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
789 aa  183  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 
440 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
638 aa  182  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
440 aa  182  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
510 aa  182  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
766 aa  181  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
935 aa  181  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2693  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
727 aa  180  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0252521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
1253 aa  179  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
589 aa  178  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1055  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
639 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
519 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
886 aa  176  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
552 aa  176  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.397898  normal  0.016153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
896 aa  176  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
737 aa  175  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
974 aa  174  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.08 
 
 
524 aa  175  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1687  signal-transducing histidine kinase  34 
 
 
565 aa  173  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10306  normal  0.175724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
1227 aa  172  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>