32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1380 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1380  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1100    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0528526  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1607  CRISPR-associated protein, Cse1 family  44.13 
 
 
534 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.982851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0594  hypothetical protein  42.94 
 
 
528 aa  413  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000341283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2479  CRISPR-associated protein, Cse1 family  38.28 
 
 
539 aa  340  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0957  hypothetical protein  38.76 
 
 
521 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2984  CRISPR-associated Cse1 family protein  38.17 
 
 
529 aa  319  6e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0427  CRISPR-associated protein, Cse1 family  34.01 
 
 
546 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00538764  normal  0.144998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3547  CRISPR-associated Cse1 family protein  36.07 
 
 
534 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.061728 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0227  hypothetical protein  35.67 
 
 
564 aa  286  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00866  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.69 
 
 
535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.046079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0864  hypothetical protein  33.09 
 
 
534 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1813  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.91 
 
 
529 aa  279  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3315  CRISPR-associated Cse1 family protein  33.94 
 
 
529 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.439764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5414  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.71 
 
 
560 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3062  CRISPR-associated Cse1 family protein  35.25 
 
 
520 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3097  crispr-associated protein, Cse1 family  32.99 
 
 
511 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000104629  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4013  CRISPR-associated protein, Cse1 family  35.55 
 
 
520 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.246071  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2888  CRISPR-associated Cse1 family protein  34.67 
 
 
520 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.447574  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0398  CRISPR-associated protein, Cse1 family  37.31 
 
 
523 aa  258  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000236732  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3137  Cse1 family CRISPR-associated protein  33.46 
 
 
518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.199062  normal  0.768115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3153  CRISPR-associated protein Cse1 family  32.72 
 
 
511 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.670831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3071  crispr-associated protein, Cse1 family  33.21 
 
 
519 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3590  CRISPR-associated protein, Cse1 family  33.9 
 
 
511 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3254  crispr-associated protein, Cse1 family  33.08 
 
 
518 aa  250  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.552745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3754  CRISPR-associated protein, Cse1 family  31.71 
 
 
508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0368406  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0174  CRISPR-associated Cse1 family protein  30.39 
 
 
555 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1385  hypothetical protein  25.74 
 
 
506 aa  91.3  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0928  CRISPR-associated protein, Cse1 family  27.01 
 
 
502 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0952  hypothetical protein  27.01 
 
 
502 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2899  hypothetical protein  26.28 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.550415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1591  hypothetical protein  26.78 
 
 
488 aa  55.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.359365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0650  CRISPR-associated Cse1 family protein  24.88 
 
 
525 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>