291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1327 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  32.54 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  38.96 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 263 aa  62  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  32.58 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  28.46 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  44 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  34.62 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  29.38 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  33.96 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  29 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  29 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  36.62 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2382  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000270616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 238 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  34.78 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  26.97 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  34.78 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  27.59 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 207 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0881  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656788  normal  0.721066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 109 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>