38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1257 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  728    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  51.6 
 
 
352 aa  338  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  45.4 
 
 
337 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  45.35 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  43.39 
 
 
346 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  44.31 
 
 
347 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  40.63 
 
 
347 aa  235  8e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  30.77 
 
 
347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  34.22 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  35 
 
 
342 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  31.87 
 
 
344 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  28.17 
 
 
340 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  34.28 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  26.15 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.12 
 
 
352 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  27.03 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  28.19 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  25.8 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  23.03 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  26.68 
 
 
358 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  24.32 
 
 
358 aa  63.5  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  22.66 
 
 
330 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  23.57 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  22.37 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  23.72 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  25.33 
 
 
332 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  22.3 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  25.79 
 
 
338 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  26.53 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  21.94 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.96 
 
 
342 aa  50.4  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  25.09 
 
 
342 aa  50.4  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  24.93 
 
 
317 aa  49.3  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  25.36 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.26 
 
 
340 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  28.28 
 
 
330 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  24.91 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  20.82 
 
 
335 aa  42.7  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>