More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1210 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 540 aa  1116    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  33.39 
 
 		 559 aa  324  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  55.19 
 
 		 649 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  58.06 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  51.41 
 
 		 291 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  42.86 
 
 		 268 aa  139  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  49.32 
 
 		 270 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  46.48 
 
 		 197 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  45.89 
 
 		 265 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  42.36 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  35.03 
 
 		 294 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  34.85 
 
 		 277 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  35.03 
 
 		 294 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  35.37 
 
 		 310 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  47.93 
 
 		 195 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  40.13 
 
 		 310 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  38.85 
 
 		 310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  38.85 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  34.52 
 
 		 294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  38.51 
 
 		 446 aa  114  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  42.96 
 
 		 288 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  41.67 
 
 		 270 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  40.28 
 
 		 269 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  34.03 
 
 		 270 aa  107  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  40.28 
 
 		 269 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  38.89 
 
 		 268 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 962 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  32.39 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 716 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 768 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 1028 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 1039 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  29.1 
 
 		 794 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0759  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.87 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 1692 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 844 aa  67.8  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1049 aa  67.4  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.3 
 
 		 1193 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3608  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.65 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 1721 aa  65.1  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 		 1329 aa  62  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  25 
 
 		 2361 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.03 
 
 		 1313 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.43 
 
 		 983 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 1426 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.01 
 
 		 1093 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 651 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.62 
 
 		 911 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 904 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0547  sensory box protein  26.19 
 
 		 1214 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428302  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.55 
 
 		 1041 aa  58.9  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.08 
 
 		 2693 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 775 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  23.58 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.26 
 
 		 693 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166514  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 685 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 891 aa  57.4  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  26.37 
 
 		 775 aa  57  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 817 aa  57  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 		 1560 aa  57  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.84 
 
 		 639 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1289 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  21.99 
 
 		 1079 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 1339 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  24.19 
 
 		 1535 aa  56.6  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 617 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 		 888 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 832 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 789 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.4 
 
 		 684 aa  53.9  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  25.83 
 
 		 490 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.24 
 
 		 1052 aa  53.9  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.697707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1658  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  25.19 
 
 		 693 aa  53.9  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000881395  normal  0.485091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2374  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  25.19 
 
 		 693 aa  53.9  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 141 aa  53.9  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 		 782 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.75 
 
 		 845 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.19 
 
 		 953 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.37 
 
 		 1791 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.19 
 
 		 953 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1158 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  22.5 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1184 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  24.38 
 
 		 1119 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 		 1758 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  43.42 
 
 		 258 aa  52.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  21.79 
 
 		 657 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 		 1193 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 746 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0186  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.5 
 
 		 740 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.789311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1374 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>