181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1080 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  763    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  39.36 
 
 
370 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  39.36 
 
 
370 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  39.24 
 
 
363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  38.11 
 
 
363 aa  263  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  39.3 
 
 
367 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  39.3 
 
 
367 aa  262  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  35.32 
 
 
416 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  39.84 
 
 
370 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  39.57 
 
 
373 aa  257  3e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  39.89 
 
 
369 aa  255  8e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  40 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  35.71 
 
 
365 aa  249  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  38.71 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  36.49 
 
 
362 aa  243  5e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  36.58 
 
 
378 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  38.69 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  38.16 
 
 
377 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  36 
 
 
357 aa  229  8e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  34.96 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  34.83 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  36.94 
 
 
370 aa  199  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  34.55 
 
 
384 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  34.15 
 
 
376 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.08 
 
 
382 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.08 
 
 
382 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.4 
 
 
382 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.26 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  27.95 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  27.95 
 
 
390 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.19 
 
 
385 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  24.88 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  24.51 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  26.3 
 
 
380 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  24.03 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  26.55 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  24.71 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.13 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.35 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.38 
 
 
393 aa  87  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  24.18 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  24.87 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  25.28 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  24.35 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  24.18 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.23 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  24.45 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  37.01 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  27.95 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  24.18 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  25.44 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25 
 
 
393 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  23.91 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  32 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  25.98 
 
 
397 aa  79.3  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  25.61 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  23.46 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25.07 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  24.65 
 
 
388 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  23.46 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  23.7 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  23.8 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.38 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.62 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  27.49 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  23.86 
 
 
398 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1288  SMC domain protein  26.68 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0947514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  30.89 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  37.8 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.72 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  25.76 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  23.97 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  23.2 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  30.64 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  24.88 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  37.23 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  24.34 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  21.67 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  25.99 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  23.04 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  23.61 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.22 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4110  ATPase-like protein  20.05 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000135453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  26.88 
 
 
405 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  30.97 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  38.16 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1131  SMC domain protein  29.82 
 
 
450 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.526004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  42.25 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  40.54 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  38.16 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  37.84 
 
 
395 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  26.51 
 
 
430 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  35.14 
 
 
390 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  39.13 
 
 
392 aa  60.1  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  36.84 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  38.57 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  40 
 
 
390 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  40 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  40 
 
 
391 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  40 
 
 
391 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>