39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1077 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  60.97 
 
 
682 aa  885  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  5.8517e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  59.26 
 
 
684 aa  874  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  100 
 
 
681 aa  1400  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  59.18 
 
 
682 aa  872  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  60.03 
 
 
682 aa  886  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  4.32292e-07 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  58.76 
 
 
681 aa  870  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  39.5 
 
 
687 aa  494  1e-138  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  39.88 
 
 
694 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  40.21 
 
 
686 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  39.41 
 
 
679 aa  466  1e-130  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  38.12 
 
 
676 aa  466  1e-130  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  39.82 
 
 
676 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  37.44 
 
 
678 aa  461  1e-128  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  36.72 
 
 
679 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  37.46 
 
 
676 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  35.83 
 
 
678 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  35.61 
 
 
684 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  40.27 
 
 
670 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  41.74 
 
 
689 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  40.12 
 
 
686 aa  351  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  40.33 
 
 
694 aa  349  8e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  39.83 
 
 
703 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  37.24 
 
 
675 aa  297  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  35.39 
 
 
508 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  31.7 
 
 
469 aa  232  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  32.61 
 
 
531 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
470 aa  226  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  27.29 
 
 
477 aa  183  9e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  27.46 
 
 
473 aa  176  1e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  28.41 
 
 
485 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  25.49 
 
 
485 aa  138  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  25.75 
 
 
186 aa  69.3  2e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  24.03 
 
 
811 aa  51.2  6e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  22.38 
 
 
825 aa  47.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  24.4 
 
 
786 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  22.68 
 
 
804 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  9.30171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  22.43 
 
 
775 aa  45.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.6135e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  23.66 
 
 
783 aa  45.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  24.54 
 
 
810 aa  45.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>