More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1002 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1002  phage integrase  100 
 
 
408 aa  855    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.606138  decreased coverage  0.00492215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0506  phage integrase family protein  36.87 
 
 
424 aa  265  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2320  phage integrase  30.34 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.971576  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2299  phage integrase  28.29 
 
 
342 aa  99.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1324  integrase family protein  29.33 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000102488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  25.93 
 
 
295 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  26.78 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1736  integrase family protein  26.91 
 
 
417 aa  87  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.53 
 
 
290 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.89 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  29.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  29.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  29.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  29.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  29.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  29.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24 
 
 
307 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  29.41 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  27.54 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  23.97 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  30.34 
 
 
290 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  23.71 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1271  integrase family protein  33.83 
 
 
180 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0155306  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  24.21 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  24.16 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.48 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.56 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  29.56 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  23.31 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.91 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  25.78 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  28.66 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  22.88 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3195  hypothetical protein  31.51 
 
 
156 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  22.76 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.36 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  25.78 
 
 
298 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  22.03 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  23.45 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  23.99 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.63 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0431  phage integrase  23.47 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.173073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  24.32 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  25.1 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  29 
 
 
291 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  23.08 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.52 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  23.85 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  28.3 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  20.81 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.99 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  32.88 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  22.57 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.93 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  21.5 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  29.32 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  28.83 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  23.49 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.93 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.93 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.48 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  24.86 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  24.86 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  24.86 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  26.29 
 
 
304 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  27.45 
 
 
295 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  22.35 
 
 
292 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  31.65 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  27.36 
 
 
334 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  27.36 
 
 
334 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  27.36 
 
 
334 aa  67  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  31.65 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.85 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.85 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.27 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  22.41 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  20.93 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  25.73 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1241  phage integrase  28.57 
 
 
336 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  20.97 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  23.98 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.03 
 
 
302 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  20.52 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.05 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.85 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.71 
 
 
298 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 
300 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>