More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0995 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
614 aa  1259    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.3 
 
 
1694 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
4079 aa  150  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 
927 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.28 
 
 
1676 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 
1276 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 
543 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
1069 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.65 
 
 
1979 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.45 
 
 
1737 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.32 
 
 
1067 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
3560 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.26 
 
 
1138 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  20.14 
 
 
878 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.84 
 
 
810 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.71 
 
 
2240 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 
4489 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
3035 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  24.44 
 
 
576 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.55 
 
 
1056 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 
988 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
3145 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.11 
 
 
750 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.37 
 
 
1056 aa  95.5  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.14 
 
 
936 aa  94  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
2262 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 
1297 aa  92.8  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
505 aa  92.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.16 
 
 
3172 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 
632 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  18.98 
 
 
1022 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.65 
 
 
573 aa  90.5  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 
465 aa  90.1  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.86 
 
 
1056 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
265 aa  90.5  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.81 
 
 
620 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.61 
 
 
818 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 
602 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.38 
 
 
265 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
955 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.54 
 
 
725 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  22.65 
 
 
1073 aa  88.6  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
2262 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 
566 aa  87.8  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 
620 aa  87.4  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  26 
 
 
804 aa  87.4  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.36 
 
 
887 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 
634 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  20.74 
 
 
643 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
366 aa  87  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
594 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
968 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  20.21 
 
 
1421 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.05 
 
 
695 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 
934 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  20.6 
 
 
711 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 
3301 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
808 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.13 
 
 
875 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22 
 
 
1049 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 
935 aa  84.3  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 
685 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.38 
 
 
1013 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  20.04 
 
 
573 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
591 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.32 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
714 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.27 
 
 
795 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.47 
 
 
837 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  22.76 
 
 
635 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  20.69 
 
 
2059 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 
1094 aa  82  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  20.98 
 
 
745 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  20.96 
 
 
393 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 
714 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  18.95 
 
 
564 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
1112 aa  81.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
681 aa  80.1  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.82 
 
 
572 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 
615 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
847 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.51 
 
 
436 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
1161 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  26.46 
 
 
266 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.15 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 
393 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  23.46 
 
 
594 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  19.55 
 
 
740 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.72 
 
 
1486 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.6 
 
 
784 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  18.17 
 
 
758 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.24 
 
 
784 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  20.75 
 
 
486 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
673 aa  77.8  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>