198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0862 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0862  permease  100 
 
 		 356 aa  694    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0816  membrane protein-like protein  72.52 
 
 		 357 aa  512  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0016  permease  67.79 
 
 		 359 aa  441  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  52.12 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  46.98 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  46.98 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0556  permease  47.81 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0664  permease  45.63 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.7223  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  46.67 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  44.73 
 
 		 362 aa  288  9e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  44.44 
 
 		 362 aa  286  4e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  41.29 
 
 		 361 aa  279  6e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  45.3 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1899  permease  48.13 
 
 		 350 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  45.92 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0753  permease  46.47 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0377989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1485  permease  44.38 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.363242  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  45.75 
 
 		 343 aa  252  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20090  permease  43.44 
 
 		 393 aa  248  9e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  41.9 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3597  permease  39.66 
 
 		 461 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.306889 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2877  permease  43.1 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1478  permease  41.71 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.177676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1904  permease  39.24 
 
 		 433 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0893  permease  44.73 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0184  hypothetical protein  38.23 
 
 		 437 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1855  permease  43.96 
 
 		 489 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1323  permease  46.15 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0701  permease  51.61 
 
 		 479 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  23.77 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3588  permease  23.91 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573988  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0523  permease  26.09 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21531  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03018  predicted permease  23.19 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02969  hypothetical protein  23.19 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3621  putative permease  23.19 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3343  putative permease  23.19 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4470  putative permease  23.19 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0554  permease  23.19 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0547  permease  23.19 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.713723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3446  putative permease  23.19 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  23.46 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  25.25 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  23.94 
 
 		 368 aa  67  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  25.87 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  26.06 
 
 		 345 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  22.93 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  21 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  22.87 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  21.83 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  21.83 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  23.62 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  22.4 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  24.32 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  22.48 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  24.23 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  22.68 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  20.06 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  21.34 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.47 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  22.22 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  23.5 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  23.5 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  20.94 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  21.75 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.24 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  21.02 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  28.57 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.01 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  19.81 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  19.26 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  21.29 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  21.5 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  20.19 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  22.4 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  23.01 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  19.4 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  22.16 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  22.12 
 
 		 350 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  21.61 
 
 		 315 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  20.36 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  23.49 
 
 		 363 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  19.68 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  21.84 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  23.17 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  21.38 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  17.89 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  20.5 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  20.38 
 
 		 322 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  19.76 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  18.73 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  28.33 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6565  permease  24.54 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.200015  hitchhiker  0.00274163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1936  putative permease  38.98 
 
 		 111 aa  53.5  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0118434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3329  permease  35.66 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.598545 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  20.96 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  28.07 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2557  membrane protein, YraQ- like  23.81 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  22.94 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  19.29 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  24.39 
 
 		 475 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>