169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0846 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  69.12 
 
 
213 aa  288  3e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  66.02 
 
 
211 aa  287  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  67.19 
 
 
214 aa  266  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  59.22 
 
 
212 aa  248  3e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  58.67 
 
 
210 aa  236  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  56.12 
 
 
211 aa  229  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  55.56 
 
 
207 aa  221  9e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  51.94 
 
 
217 aa  207  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  50.49 
 
 
219 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  49.75 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  49.75 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  48.26 
 
 
219 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  50 
 
 
210 aa  171  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  39.7 
 
 
210 aa  161  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  45.6 
 
 
217 aa  154  9e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  43.08 
 
 
225 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  47.85 
 
 
200 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  42.46 
 
 
204 aa  145  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  45.95 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  41.79 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  44.44 
 
 
200 aa  145  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  42.5 
 
 
202 aa  142  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  40.1 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  38.14 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  44.81 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0529482 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.94 
 
 
196 aa  138  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 
203 aa  131  6e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  39.57 
 
 
283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  41.71 
 
 
243 aa  129  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  42.37 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  36.22 
 
 
203 aa  128  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  39.44 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 
203 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  42.29 
 
 
237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  36.73 
 
 
203 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  36.87 
 
 
297 aa  122  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  38.98 
 
 
234 aa  119  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  37.7 
 
 
196 aa  119  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  43.1 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  34.52 
 
 
301 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  32.67 
 
 
296 aa  111  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  33.51 
 
 
282 aa  109  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  34.58 
 
 
303 aa  105  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  34.9 
 
 
272 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  34.93 
 
 
250 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  37.82 
 
 
197 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  33.49 
 
 
267 aa  96.3  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1495  20S proteasome A and B subunits  33.49 
 
 
280 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  34.43 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2426  20S proteasome A and B subunits  32.86 
 
 
288 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167637  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0910  20S proteasome A and B subunits  32.23 
 
 
273 aa  88.2  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135813  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  33.33 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2001  20S proteasome A and B subunits  32.04 
 
 
276 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  32.35 
 
 
247 aa  87.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  27.64 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4879  20S proteasome A and B subunits  31.28 
 
 
274 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.73 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  33.5 
 
 
271 aa  86.3  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  38.32 
 
 
259 aa  85.9  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1188  proteasome subunit beta  28.31 
 
 
290 aa  85.9  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.846216  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2244  20S proteasome, A and B subunits  32.41 
 
 
324 aa  85.1  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375012  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2627  proteasome subunit beta  29.58 
 
 
304 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  34.47 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2969  20S proteasome A and B subunits  32.98 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000842797  normal  0.0126547 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  28.95 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  38.1 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  38.1 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  34.88 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1488  20S proteasome A and B subunits  32.38 
 
 
270 aa  82  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2463  20S proteasome A and B subunits  33.69 
 
 
292 aa  82  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  38.1 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  26.7 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  26.96 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2361  20S proteasome A and B subunits  31.22 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  31.19 
 
 
240 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  24.87 
 
 
206 aa  79  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20870  proteasome endopeptidase complex, beta component  32.4 
 
 
285 aa  78.6  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  27.59 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3077  20S proteasome, A and B subunits  31.22 
 
 
303 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.137735 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  26.88 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  30.85 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4461  20S proteasome A and B subunits  30.23 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.126997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  30.58 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  31.68 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3130  proteasome subunit beta  30.7 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3191  proteasome subunit beta  30.7 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166463  normal  0.0826974 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2311  20S proteasome A and B subunits  27.88 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000180719  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3141  proteasome subunit beta  30.7 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.738007  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  33.33 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  28.88 
 
 
204 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  33.33 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3449  20S proteasome, A and B subunits  30.56 
 
 
306 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.373624  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1919  20S proteasome A and B subunits  32.04 
 
 
273 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000109069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2159  20S proteasome A and B subunits  30.09 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  32.84 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  31.58 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1873  20S proteasome A and B subunits  30.73 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.801256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5871  20S proteasome alpha and beta subunits-like protein  30.24 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1832  proteasome endopeptidase complex  32.84 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>