24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0772 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  29.43 
 
 
600 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  28.18 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  29.39 
 
 
684 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  28.95 
 
 
435 aa  92.8  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  25.9 
 
 
436 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  27.23 
 
 
546 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  21.77 
 
 
460 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  32.89 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  25.44 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  32 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  23.17 
 
 
561 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  23.77 
 
 
727 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  25.19 
 
 
963 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  26.38 
 
 
326 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  25 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  25.97 
 
 
412 aa  53.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  29.93 
 
 
409 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  28.1 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  27.61 
 
 
1096 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0524  hypothetical protein  27.72 
 
 
463 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.195293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  26.32 
 
 
426 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  34.74 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 
752 aa  42.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>