207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0759 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  805    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2199  hypothetical protein  42.5 
 
 		 400 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.748449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  37.76 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1426  hypothetical protein  41.67 
 
 		 402 aa  276  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.407629  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  32.59 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  31.34 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  22.85 
 
 		 389 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  26.44 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.98 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.56 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  23.08 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  22.15 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 		 830 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  21.18 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  24.74 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.86 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  22.85 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.97 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.24 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.3 
 
 		 415 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25.82 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.54 
 
 		 395 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  23.21 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.06 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.38 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.95 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  24.18 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.13 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  22.48 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.9 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  22.26 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.3 
 
 		 419 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  20.75 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.64 
 
 		 397 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  22.38 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  21.96 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  23.22 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.41 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  22.57 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.61 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.32 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  24.03 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  21.68 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.05 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.68 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  25.2 
 
 		 1132 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.49 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.07 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.37 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25.32 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.6 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.06 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.55 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  30.4 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 		 1132 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1547  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.25 
 
 		 417 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.14 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.62 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.9 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0917  hypothetical protein  24.17 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  23.51 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.93 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0813  hypothetical protein  24.45 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1860  PglC  25.53 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000429042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.6 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  29.92 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  21.9 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2346  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.94 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  21.34 
 
 		 856 aa  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  22.17 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  35.25 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  20.43 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.12 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.82 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1629  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.12 
 
 		 759 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.258013 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.86 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  21.56 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  20.43 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.89 
 
 		 851 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  21.85 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.5 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  21.26 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.41 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.17 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.88 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  23.96 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.15 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  22.32 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1634  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.27 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0870078  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  26.56 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>