More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0551 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1149 aa  2364  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  37.65 
 
 
1080 aa  671  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  30.96 
 
 
1057 aa  433  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  30.01 
 
 
1226 aa  305  4e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 
1074 aa  231  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 
1117 aa  227  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.55 
 
 
1061 aa  225  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 
1110 aa  201  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.14 
 
 
1244 aa  200  1e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  25.35 
 
 
1392 aa  192  3e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  26.58 
 
 
1262 aa  191  6e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.6 
 
 
1230 aa  188  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 
1184 aa  187  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 
1147 aa  187  1e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 
1123 aa  186  2e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  30.29 
 
 
1047 aa  186  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  30.97 
 
 
1115 aa  182  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.41 
 
 
1251 aa  177  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  24.2 
 
 
1157 aa  177  1e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  30.4 
 
 
1196 aa  177  1e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  24.9 
 
 
1177 aa  176  2e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  25.78 
 
 
1155 aa  176  3e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.69 
 
 
1405 aa  174  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  29.1 
 
 
1131 aa  173  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.47 
 
 
1177 aa  171  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  25 
 
 
1173 aa  168  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 
1185 aa  168  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  27.88 
 
 
1107 aa  165  5e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 
1121 aa  162  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  25.47 
 
 
1162 aa  161  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  26.68 
 
 
1248 aa  160  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  29.21 
 
 
1110 aa  159  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  28.6 
 
 
1124 aa  156  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  26.13 
 
 
1204 aa  157  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  24.92 
 
 
1392 aa  155  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  22.86 
 
 
854 aa  154  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  26.63 
 
 
1244 aa  154  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4014  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.11 
 
 
1226 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.398722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1693  Exodeoxyribonuclease V  25.35 
 
 
1125 aa  152  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1439  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 
1195 aa  151  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  27.27 
 
 
1242 aa  150  1e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  26.82 
 
 
1218 aa  150  2e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2512  UvrD/REP helicase  30.35 
 
 
1192 aa  148  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  25.51 
 
 
1125 aa  148  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  27.61 
 
 
1242 aa  148  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.27 
 
 
1157 aa  148  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.9 
 
 
1241 aa  147  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  26.12 
 
 
1241 aa  147  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.98 
 
 
1240 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.07 
 
 
1233 aa  146  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1341  UvrD/REP helicase  29.47 
 
 
1195 aa  145  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.638227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.73 
 
 
1241 aa  145  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  26.05 
 
 
1241 aa  145  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  26.05 
 
 
1241 aa  145  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  26.05 
 
 
1241 aa  145  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.73 
 
 
1241 aa  145  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  26.29 
 
 
1241 aa  145  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  26.27 
 
 
1282 aa  145  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  26.47 
 
 
1241 aa  144  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 
1173 aa  144  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 
1240 aa  144  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  25.37 
 
 
1377 aa  143  2e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.2 
 
 
1240 aa  142  4e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  27.44 
 
 
1203 aa  142  4e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.88 
 
 
1089 aa  141  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 
1161 aa  140  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  26.89 
 
 
1118 aa  139  3e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.43 
 
 
1197 aa  139  3e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  24.47 
 
 
1121 aa  139  3e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.05 
 
 
1186 aa  138  6e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  29.84 
 
 
1180 aa  138  6e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  23.11 
 
 
1087 aa  137  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.97 
 
 
1183 aa  137  1e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  26.41 
 
 
1217 aa  137  1e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  26.41 
 
 
1217 aa  137  1e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  23.52 
 
 
1124 aa  136  2e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  24.06 
 
 
1132 aa  137  2e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2130  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.22 
 
 
1223 aa  136  2e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  25.58 
 
 
1106 aa  137  2e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 
706 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 
1173 aa  135  4e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.77 
 
 
1251 aa  135  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  26.71 
 
 
1236 aa  135  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 
1120 aa  134  1e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.45 
 
 
763 aa  133  2e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  29.21 
 
 
1180 aa  132  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.97 
 
 
1139 aa  132  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.97 
 
 
765 aa  132  4e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  24.03 
 
 
1089 aa  131  7e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  25.73 
 
 
1187 aa  131  9e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  25.03 
 
 
1106 aa  130  2e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4844  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 
776 aa  130  2e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  26.82 
 
 
1230 aa  129  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1244  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 
1165 aa  128  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0173598  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  29.03 
 
 
1180 aa  128  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.77 
 
 
773 aa  127  8e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.13 
 
 
742 aa  128  8e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  1.00763e-07 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 
768 aa  127  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  25.83 
 
 
1110 aa  127  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  25.64 
 
 
1110 aa  127  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>