More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0542 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0542  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  293  7e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  33.78 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  41.38 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.94 
 
 
180 aa  70.1  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  29.49 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  30.41 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.08 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.1 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  33.97 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.17 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.11 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  40 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.51 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.25 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  31.76 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  30.82 
 
 
341 aa  60.5  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.55 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  34.23 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  31.36 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.33 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  29.45 
 
 
345 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  30.63 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  41.03 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  41.03 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.36 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.86 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  29.66 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  31.47 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.86 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2957  UspA domain protein  29.25 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0210992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  29.66 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  37.18 
 
 
151 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  32.64 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  34.67 
 
 
321 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
290 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.26 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  30.13 
 
 
295 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  26.8 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.89 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  34.62 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.41 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  36.36 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  29.38 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.87 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0018  UspA domain protein  28.17 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  33.1 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  33.78 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  33.33 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.72 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.19 
 
 
143 aa  52.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.97 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74592  universal stress protein (USP) family protein possible involvement in nucleo-mitochondrial control of maltose, galactose and raffinose utilization  30.61 
 
 
480 aa  52.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  31.25 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  28 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  30.41 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.61 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  28.29 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  33.78 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.54 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  33.33 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  26.28 
 
 
162 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.03 
 
 
299 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
218 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 
159 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  31.13 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  31.58 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  44.07 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.21 
 
 
308 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  26.67 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  29.8 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  30.87 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  28.67 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.97 
 
 
284 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  31.48 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
143 aa  50.8  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  46.43 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  32.41 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  28.97 
 
 
288 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
166 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  31.25 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  33.97 
 
 
303 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>