101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0504 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  100 
 
 
213 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  69.48 
 
 
216 aa  314  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  38.81 
 
 
224 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  44.21 
 
 
221 aa  144  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  42.63 
 
 
221 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  46.47 
 
 
221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  43.82 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  38.64 
 
 
236 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  41.46 
 
 
217 aa  122  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  34.4 
 
 
236 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  27.65 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  26.71 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  30.35 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  33.86 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  26.95 
 
 
220 aa  71.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  32.89 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  32.24 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  29.94 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1630  hypothetical protein  31.33 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  34.72 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  47.14 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  27.85 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  32.35 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  32.03 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  38.61 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  30.16 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  25.57 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  33.66 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  37.04 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  27.21 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  26.82 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  29.09 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  24.86 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  28.57 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  31.3 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 
820 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  28.95 
 
 
238 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1683  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33 
 
 
803 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  27.82 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  26.77 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.43 
 
 
845 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  23.12 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  24.44 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  25.19 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  24.44 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  25.78 
 
 
792 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.78 
 
 
792 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  25.19 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  27.97 
 
 
784 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 
814 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  36.9 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  25.71 
 
 
228 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0210  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.91 
 
 
810 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2238  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.09 
 
 
799 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.39329  normal  0.0221267 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2609  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.09 
 
 
799 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.65 
 
 
854 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  24.22 
 
 
792 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2494  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.96 
 
 
795 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0476201  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  30.49 
 
 
227 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  26.61 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  23.44 
 
 
792 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1306  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  30.63 
 
 
810 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927981  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0501  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26 
 
 
772 aa  45.8  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1309  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.07 
 
 
799 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2049  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.36 
 
 
794 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  30.6 
 
 
232 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2298  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.53 
 
 
801 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.184232  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3039  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.43 
 
 
803 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0321898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.27 
 
 
808 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30 
 
 
801 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.263135  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0448  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.47 
 
 
818 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2466  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  33.33 
 
 
827 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1284  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.25 
 
 
791 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1416  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  35.29 
 
 
801 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0211445  normal  0.563013 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.6 
 
 
793 aa  43.5  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  31.19 
 
 
803 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000980534  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.61 
 
 
794 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0209  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.62 
 
 
807 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.212777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2129  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.79 
 
 
803 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.957616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.37 
 
 
816 aa  42.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  22.06 
 
 
792 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  22.06 
 
 
792 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4536  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  37.68 
 
 
807 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.140615 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0280  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.82 
 
 
807 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.52 
 
 
815 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1339  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.16 
 
 
807 aa  42.4  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.217856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.47 
 
 
797 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  27.78 
 
 
239 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2315  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.35 
 
 
803 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507205  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3487  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.15 
 
 
808 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.72 
 
 
780 aa  42.4  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  22.94 
 
 
792 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  22.03 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0618  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.77 
 
 
825 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0228815  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0730  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.43 
 
 
789 aa  42  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.237093  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3316  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.19 
 
 
828 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.350397  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1217  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.56 
 
 
805 aa  42  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000796481  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1880  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  36.76 
 
 
861 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114017  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4611  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.78 
 
 
815 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16834  normal  0.0519802 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>