22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0501 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0501  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  323  8.000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1154  transcriptional regulator, XRE family  56.17 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.501074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0106  helix-turn-helix domain-containing protein  58.39 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0071  XRE family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 161 aa  189  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000421347 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2112  helix-turn-helix domain-containing protein  55.28 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2739  transcriptional regulator, XRE family  57.76 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0808  hypothetical protein  41.25 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0743  hypothetical protein  41.88 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1289  hypothetical protein  40.62 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0078  XRE family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1175  hypothetical protein  41.88 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1033  XRE family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2130  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.120661  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0738  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0931337  normal  0.163713 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1633  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1696  transcriptional regulator, XRE family  33.96 
 
 		 371 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324356  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 115 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0958  DNA-binding protein  45.24 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 179 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0878  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 97 aa  41.6  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3445  helix-turn-helix domain-containing protein  38.36 
 
 		 335 aa  40.8  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>