45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0492 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  34.47 
 
 		 728 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  34.15 
 
 		 448 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  32.35 
 
 		 560 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  38.56 
 
 		 669 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  32.2 
 
 		 1202 aa  97.1  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.61 
 
 		 713 aa  94.4  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  37.58 
 
 		 1001 aa  93.2  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  42.59 
 
 		 126 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  33.73 
 
 		 1042 aa  91.7  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  35.29 
 
 		 938 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  36.22 
 
 		 171 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  34.46 
 
 		 960 aa  85.1  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  29.38 
 
 		 769 aa  83.6  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  28.33 
 
 		 1361 aa  84.3  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  41.49 
 
 		 675 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  33.12 
 
 		 581 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.87 
 
 		 971 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 1279 aa  77.8  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  34.18 
 
 		 658 aa  77  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  30.51 
 
 		 403 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  31.01 
 
 		 374 aa  71.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  34.03 
 
 		 996 aa  71.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  30 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  24.69 
 
 		 815 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  26.11 
 
 		 685 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  28.31 
 
 		 679 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  36.71 
 
 		 517 aa  51.6  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  31.11 
 
 		 442 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  30.39 
 
 		 439 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.78 
 
 		 367 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.12 
 
 		 450 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  35.62 
 
 		 441 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  30.49 
 
 		 442 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  21.24 
 
 		 819 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  26.47 
 
 		 329 aa  45.1  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1859  hypothetical protein  21.99 
 
 		 529 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.956553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  23.85 
 
 		 620 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  23.56 
 
 		 1060 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  21.81 
 
 		 436 aa  42.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.12 
 
 		 446 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  22.22 
 
 		 462 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.36 
 
 		 445 aa  41.6  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  28.47 
 
 		 514 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  26.67 
 
 		 450 aa  41.2  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>