More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0329 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 
234 aa  255  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  54.7 
 
 
234 aa  254  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1539  ABC transporter related  53.85 
 
 
234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  50.85 
 
 
234 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 
234 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  49.57 
 
 
234 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  49.57 
 
 
234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  238  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  50.21 
 
 
235 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  51.71 
 
 
234 aa  236  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4553  ABC transporter related  50.21 
 
 
234 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03303  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  49.14 
 
 
237 aa  234  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0261  ABC transporter related protein  49.14 
 
 
237 aa  235  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03256  hypothetical protein  49.14 
 
 
237 aa  234  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4770  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
237 aa  234  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3735  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
237 aa  234  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3872  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
237 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0843862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3762  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
237 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3933  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
233 aa  234  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3931  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
237 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  47.01 
 
 
236 aa  234  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3751  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
237 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3829  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
237 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.441456  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  45.49 
 
 
237 aa  234  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0262  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  49.14 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  45.26 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0614  ABC transporter related  53.25 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  48.93 
 
 
236 aa  233  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  46.78 
 
 
238 aa  232  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.62 
 
 
235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
238 aa  231  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
237 aa  231  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50 
 
 
235 aa  231  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.21 
 
 
239 aa  231  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
244 aa  231  6e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  48.5 
 
 
235 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  47.62 
 
 
238 aa  231  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.84 
 
 
233 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  48.48 
 
 
256 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  47.84 
 
 
233 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  47.84 
 
 
233 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  43.78 
 
 
238 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  43.78 
 
 
238 aa  231  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
233 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  46.35 
 
 
239 aa  231  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
234 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 
238 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  49.15 
 
 
234 aa  230  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 
238 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0098  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.72 
 
 
262 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 
238 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 
238 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  43.78 
 
 
238 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3652  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.71 
 
 
233 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 
238 aa  230  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 
238 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.94 
 
 
236 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  45.89 
 
 
234 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  47.84 
 
 
233 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3868  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
233 aa  229  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 
238 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50560  branched-chain amino acid transport protein BraG  47.84 
 
 
233 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0125838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  47.68 
 
 
270 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.78 
 
 
238 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  49.79 
 
 
239 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  48.28 
 
 
234 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
233 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5320  ABC transporter related  46.35 
 
 
254 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  50.64 
 
 
234 aa  228  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  45.06 
 
 
265 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  48.93 
 
 
234 aa  228  7e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  48.28 
 
 
231 aa  228  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  44.21 
 
 
238 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3586  ABC transporter related  46.35 
 
 
254 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0486614  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2532  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 
254 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.07 
 
 
235 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0145  ABC transporter related  46.81 
 
 
243 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  45.49 
 
 
238 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1383  ABC transporter related  48.28 
 
 
233 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.334561  normal  0.312332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  47.86 
 
 
240 aa  227  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  45.92 
 
 
239 aa  227  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  45.26 
 
 
233 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  45.06 
 
 
264 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  46.98 
 
 
233 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3970  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.28 
 
 
233 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.394941  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  46.98 
 
 
233 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>