More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0290 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  100 
 
 		 361 aa  719    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  53.39 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  54.51 
 
 		 383 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  45.25 
 
 		 367 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  51.74 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  43.43 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  39.31 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  38.19 
 
 		 362 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  39.89 
 
 		 357 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  42.37 
 
 		 355 aa  238  9e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.64 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  39.38 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  40.87 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.9 
 
 		 348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.62 
 
 		 348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  42.36 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  38.46 
 
 		 348 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  40.86 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 		 373 aa  229  4e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  41.18 
 
 		 358 aa  228  9e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  39.43 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  35.62 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  39.44 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  36.19 
 
 		 370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  38 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  38.96 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  38.96 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  37.54 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  38.62 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  40.96 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  37.93 
 
 		 357 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  36.76 
 
 		 356 aa  212  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 		 343 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  42.96 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  37.64 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 		 336 aa  205  9e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  35.31 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  40.37 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  41.04 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  40.55 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  34.9 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  36.42 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.46 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  39.18 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  36.81 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  36.16 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.11 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4204  transport system permease protein  40.21 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.69 
 
 		 346 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  35.92 
 
 		 356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.23 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  36.46 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.47 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  31.84 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.16 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  38.78 
 
 		 345 aa  197  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  41.55 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  37.85 
 
 		 357 aa  195  9e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  39.93 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  38.31 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  38.72 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  36.2 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  38.71 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.1 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  33.9 
 
 		 337 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  37.42 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  38.86 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  36 
 
 		 354 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.97 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  36.76 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  37.76 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  41.03 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  40.07 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  38.13 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  34.8 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.85 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  34.11 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  37.72 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  36.7 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  34.26 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.97 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  37.8 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  38.76 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  38.83 
 
 		 359 aa  185  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  39.05 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  38.59 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  36.18 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  37.38 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  34.11 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  37.79 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  34.11 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2697  transport system permease protein  37.59 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  35.94 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>